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海洋浮游病毒是海洋生态系统中丰度最高,多样性极为丰富,生物量仅次于原核生物的有机体.由于对宿主的侵染和裂解作用,海洋浮游病毒影响和调节着微生物的群落结构和生物地球化学特征以及海洋生态系统中的物质和能量的流动.
为从个体水平上了解海洋浮游病毒及其与宿主的相互作用,本研究一方面从海洋噬菌体的分离入手,在中国东海海域分离得到一株侵染海洋副球菌的噬菌体PMJL(φ)1,并在此基础上,从生理与基因水平上对该病毒进行了研究和描述;另一方面,在取于同一站位的在4℃中存放一年之久的海洋病毒浓缩液分离得到一株海洋细菌JLT2000.由于其独特的分离得到途径,研究其长久的耐寒及抗病毒机制有很大的意义.另外,由于其与已鉴定菌株较低的相似性,我们首先对其作了细菌学鉴定.本文的研究结果如下:
(1)在中国东海海域分离得到的噬菌体PMJL(φ)1从形态上看属于长尾噬菌体,有一个直径约50 nm的等轴的头部,长约122 nm,宽约10 nm的可弯曲,不可收缩的尾部.侵染宿主JL65的潜伏期及裂解量分别约为30 min和27.对氯仿的敏感度具有浓度依赖性.此外,PMJL(φ)1为双链DNA病毒,基因组为环状,总长度为42,093 bp,G+C含量为56.37%.在该病毒基因组中预测得到53个ORF,其中大约55%的基因是未知的.有推测功能的基因包括DNA复制相关的基因,编码结构蛋白相关的基因及其它参与到DNA代谢,氨基酸代谢,转录调节等过程的基因.另外值得注意的是在病毒的基因组中存在4个与GTA类似的基因.PMJL(φ)1的53个ORF中有22个与一株分离于假单胞菌的噬菌体PA73有最高及较高的相似性,8个ORF与本实验室一株分离鉴定并全基因组测序的海洋细菌Citromicrobium sp.JLT1363有着最高及较高的相似性.
(2) JLT2000为一株革兰氏阴性菌,严格好氧,化能异养,氧化酶,接触酶阳性.菌体形态为拟杆状,具有运动性,可以在6-9的pH值范围内,4-40℃的温度范围内,0-12%的盐度范围内生长.它可以利用D-半乳糖,甘露醇,海藻糖,二水D-葡萄糖酸钠,丙酮酸钠,α-乳糖,纤维二糖,山梨醇,肌醇,L-谷氨酸钠,葡萄糖等单碳源;并且可以利用甘露醇,葡萄糖,蔗糖,乳糖,纤维二糖,海藻糖,肌醇,D-半乳糖等糖醇类产酸.可以水解七叶苷,淀粉,几丁质,酪素,不能水解琼脂,纤维素,明胶,尿素,DNA.脂肪酸的主要组分有iso-C15:0,iso-C15:03-OH,iso-C17:03-OH,Sum In Feature3(16∶1 w7c/16∶1 w6c).极性脂成分较为单一,包括一种磷脂酰甘油(PG),和两种心磷脂(DPG1,DPG2).JLT2000对四环素,氯霉素,红霉素,麦迪霉素,万古霉素,氧氟沙星,环丙沙星,克拉霉素,克林霉素敏感.JLT2000与Marivirga sericea LMG13021T有最高的的相似性,为96.1%,与Marivirgatractuosa KCTC2958T的16S相似性为95.77%.