随着我国由传统的计划经济体制向社会主义市场经济体制转型以及政治体制改革的不断深入,以往政府和单位包办式管理模式已经不适应经济社会发展的需要,政府和单位的职能向社会分流,社区建设被提上日程。由于我国社区建设是由政府启动和指导的,政府在社区中的作用至关重要,基层政府在社区建设中担当指导与服务、协调与监督的角色。然而,社区建设的目标是实现社区自治,并通过社区自治组织的协助功能对政府工作起促进作用。在社区建设中,能否形成基层政府与社区自治组织的良性互动机制,既关系到降低政府成本、提高社会微观层面管理效率,也关系到基层社会民主政治建设的发展以及密切党和政府同人民群众的关系。自20世纪90年代我国社区建设开展以来,围绕处理基层政府与社区自治组织之间的关系,各地积极实践探索,取得了一些积极的经验,但从全国层面看,依然存在诸多问题。如何解决这些问题,已经成为社区建设中理论研究和实践操作的亟待解决的重要课题。本文以法律法规为依据,阐明我国社区建设中基层政府与社区自治组织之间的法定关系,并通过宏观层面的资料分析以及实地个案调查,剖析目前我国社区建设中基层政府与社区自治组织之间的现存关系,归纳出社区建设中基层政府和社区自治组织关系中存在的问题：基层政府代行自治事务和服务不到位等功能错位与缺位；社区自治组织的协助功能发挥不力；千篇一律的关系模式造成角色功能失效。在此基础上,本文针对产生问题的原因分析,运用本文梳理的相关理论,借鉴他国相关经验,提出解决问题的思路和措施：深化政治体制改革,理顺基层政府与社区自治组织之间的关系；政府投入制度化,逐步建立多元化的社区建设筹资机制；按照构建服务型政府的要求做好基层政府的规划引导、服务协调工作；强化社区居民参与意识,完善居民参与机制；遵循因地制宜原则,构建有差异的多元关系模式。