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丙型肝炎直接抗病毒治疗药物(DAA)的批准使用是丙型肝炎(Hepatitis C)治疗史上的一次旅程碑。但是病毒选择性突变的出现,使得治疗过程中病毒对药物产生耐受性,而导致治疗的失败。因此,探究丙型肝炎治疗过程中病毒对药物产生耐药的机制非常重要,其对于未来抗耐药性抑制剂的设计和开发具有重要的理论指导意义。在本论文中,我们选择了丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus,HCV)直接抗病毒治疗的关键靶点NS3/4A蛋白酶作为研究对象。首先,通过分子动力学(molecular dynamics,M