RNA模板介导同源重组修复的探讨及不同CRISPR/Cas9系统的比较研究

来源 :西北农林科技大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:sdsdfe45
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
DNA的损伤类型各异,尤为严重和致命的当属DNA双链断裂(double strand breaks,DSBs),机体主要通过同源重组修复来保证基因组的完整性。同源重组是一种分子过程,在各种生物DNA代谢中具有多重作用,一般情况下,发生在DNA分子之间。通过同源重组修复机制,可精确编辑基因组序列,实现目标基因的定向编辑,应用于安全动物育种。同时对肿瘤等疾病的防治意义重大,在基因治疗方面优势明显。自然界各个物种细胞中,均存在有大量的DNA和RNA分子,且RNA分子的数量和种类远胜于DNA分子。考虑到细胞中RNA转录产物的丰度,RNA可能会对基因组的稳定性和可塑性产生影响。在纤毛虫、细菌及酵母细胞中,已有相关报道指出:RNA能够直接与DNA进行同源互作,对DNA损伤进行修复,而在哺乳动物细胞中还未见相关可供参考的研究报道出现。因此,本论文主要对哺乳动物细胞中是否存在以RNA为模板的DNA编辑和改造过程进行了尝试性地探讨,期望能在哺乳动物细胞DNA复制和修复过程中发现与酵母细胞等类似的RNA-DNA互作效应,为其DNA损伤修复机制提供一个新的途径。其次,对不同CRISPR/Cas9系统核酸酶活性高低进行比较,构建得到一套工作效率相对较高的打靶系统,为未来关于RNA介导重组的探索过程,提供有效的技术手段,创造更高效的双链断裂效应,从而提高基因编辑效率。在报告载体水平,设计并构建获得以β-actin基因外显子3(exon3)&外显子4(exon4)、外显子3(exon3)&外显子5(exon5)为DNA重组修复模板的融合有eGFP报告基因的Actin E3&4和Actin E3&5两种同源重组报告系统,与Cas9-sgRNA表达载体共转染HEK293T细胞,在细胞内源转录产物β-actin mRNA的同源介导下,实现β-actin基因的精确修复。实时荧光观察后提取细胞基因组,设置不同策略的PCR鉴定。在分子水平上并未检测到相应的RNA编辑结果。设计并构建piggy Bac-报告载体,与转座酶载体稳转293A细胞系,遗传霉素(G418)筛选后成功构建获得随机整合报告细胞系pB-293A。在细胞系基因组水平,将Cas9-sgRNA打靶载体和在细胞内表达eGFP mRNA同源模板的供体载体共转染,利用博来霉素(zeocin)筛选富集阳性细胞,测序鉴定。鉴定结果表明,富集得到的细胞样品中,并未检测到经过精确编辑的阳性结果。分别设计并构建有关sgRNA二级结构、sgRNA 5’端酶切位点及hst Ca9和hspCas9的相关CRISPR/Cas9表达载体,与SSA报告载体共转入HEK293T细胞,通过流式细胞术计数检测,量化分析报告载体水平不同CRISPR/Cas9系统的工作效率,比较得出sgRNA二级结构较为稳定的hstCas9系统核酸酶活性相对较高,为21.15%。哺乳动物细胞中,由于系统检测灵敏度等原因,无论在载体水平还是基因组水平,均未检测到RNA模板介导的同源重组修复阳性结果。在目前并无相关可供参考的文献报道的前提下,这种关于哺乳动物细胞中能否发生RNA与DNA直接的同源互作及遗传信息交流的探索过程,具有一定的科研选题独特性和创新性,可以为以后针对该系统的优化设计提供借鉴,同时为未来开展相关的研究提供思路。
其他文献
目的:观察敦煌消肿镇痛膏对下肢骨折致膝关节功能障碍患者功能恢复的影响。方法:将符合入选标准80例下肢骨折致膝关节功能障碍患者随机分为观察组、对照组各40例。两组患者均
碎片化资源是适应现代学习特点的资源形式,但也给学习者带来了一定的认知障碍。如何将这些资源组织起来,为学习者提供科学的学习路径是碎片化学习资源建设的关键问题。文章以
本文综述了近年来对不同种类瓢虫之间、瓢虫与其他天敌之间集团内捕食作用的研究进展,阐述了影响瓢虫集团内捕食作用的关键因素,探讨了集团内捕食对害虫生物防治的影响。综述为
电子测量是一门综合性较强的课程,其中涉及的测试设备和测试方法被广泛地用于电路的指标测试中。该文以集成电路作为测试对象构建知识地图,打乱章节之间人为划分的界限,加强
目前很多学生在大量的家庭作业压力下不堪重负。因此,作者结合教学实践,对家庭作业作了一些优化措施,试图使之能够真正促进学生知识的习得和技能的强化。本文作者优化作业的
本文通过分析了解贵州引进FDI的现状及特点,依据传统柯布-道格拉斯生产函数,结合内生增长理论建立技术溢出效应模型,进行实证分析,结果表明FDI对贵州技术进步仅存在FDI自身生
犯罪构成理论要求重视犯罪概念的意义。实质的犯罪概念与形式的犯罪概念是相互补充的关系。实质的犯罪概念以对犯罪的实质合理性的定义为追求目标,因此,它是一个不断变化的概念
目的:研究延续性康复护理对复杂性手外伤患者显微外科手术功能恢复的影响。方法 :选取自2018年1月至2018年6月于我院进行显微外科修复手术的70例复杂性手外伤患者为研究对象,
2013年4月,阿里金融继小微企业融资产品之后推出信用支付功能,这一功能先期只开通手机无线支付,在部分地区试用,随后攫盖全国大部分城市。事实上,早在2011年6月,中国银联就在北京正
目的:研究独活的化学成分并建立提取方法.方法:采用超临界CO2-分子蒸馏技术对独活化学成分进行萃取与分离,并对其提取物和蒸出物进行GC-MS分析.结果:从超临界CO2萃取物和蒸山