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目的:近年来,临床显性自身免疫性甲状腺病(Autoimmune thyroid disease,AITD)的患病率为2-3%,而在一般人群中甲状腺自身抗体的患病率超过15%。AITD可以增加非甲状腺疾病的风险如心血管疾病、癌症和不良妊娠结局,因而引起人们的广泛重视。甲状腺是人体重要的器官,甲状腺结构的破坏和进行性的功能丧失使得桥本甲状腺炎(Hashimoto’s thyroiditis,HT)的进程复杂化。尽管桥本甲状腺炎早在一个世纪以前就已经被发现,然而,它的发病机制仍不明确。目前认为,遗传易感性、环境因素及免疫失调因素的相互作用对该病的发生有影响。长链非编码RNA(long non coding RNA,lncRNA)可调节免疫反应,包括T细胞分化、树突状细胞功能和细胞因子产生,能够以细胞类型特异性方式在自身免疫性疾病中起作用;lncRNA在不改变遗传物质的情况下,在转录、转录后及翻译水平参与免疫应答,维持免疫稳态。本研究通过收集甲状腺细胞RNA进行基因及转录组mRNA、lncRNA的高通量测序及后续验证,进而分析甲状腺原代细胞中的长链非编码RNA的表达情况。研究方法:1.于手术室收集16例桥本甲状腺炎(HT)及16例正常甲状腺组织(NC),消化分离后分别进行甲状腺原代细胞的培养,并进行免疫荧光鉴定。2.使用Illumina HiSeq平台,测序长度50bpx200m,取HT组及NC组分别进行基因和转录组水平的mRNA及lncRNA进行高通量测序。3.收集30例桥本甲状腺炎(HT)及30例正常甲状腺组织(NC),再次进行甲状腺细胞的培养,收集RNA,使用Real-time PCR技术验证甲状腺原代细胞中差异的lncRNA的表达情况。结果:1.在本次高通量测序中,对比了HT组和NC组的甲状腺细胞中的mRNA、LncRNA基因及转录本,发现HT组与NC组相比,上调的差异的lncRNA的数量为2573个,下调的差异的lncRNA的数量为15778个。2.选择其中37个lncRNA进行Real-Time PCR验证后,得到验证的差异lncRNA为6个(P<0.05)。其中,NONHSAT185097.1、NONHSAT152327.1、NONHSAT183385.1、NONHSAT213829.1、NONHSAT245695.1这些lncRNA都与甲状腺抗体呈相关关系。结论:1.通过对组间差异基因的KEGG分析发现,差异的lncRNA主要富集于自身免疫性甲状腺疾病、系统性红斑狼疮、类风湿关节炎、原发性免疫缺陷等疾病,以及B细胞受体信号通路、NF-κB信号通路、自然杀伤细胞介导的细胞毒性作用等。2.经验证NONHSAT181139.1、NONHSAT185097.1等lncRNA在桥本甲状腺炎细胞中上调表达;NONHSAT152327.1、NONHSAT183385.1、NONHSAT213829.1、NONHSAT245695.1等lncRNA在桥本甲状腺炎细胞中下调表达。3.Spearman分析发现lncRNA:NONHSAT185097.1与TPOAb呈正相关,相关系数为0.469,P=0.016(按P=0.05标准);lncRNA:NONHSAT152327.1与TPOAb、TGAb呈相关关系(P<0.05)。