随着磁共振医学影像在医学应用中的普及,无论对于医学诊断还是科学研究,对图像的质量要求都越来越高。本论文对磁共振系统中存在的几何形变与灰度不均匀这两个影响图像质量的问题进行了研究,在对现存算法研究的基础上进行改进,提出了自己的算法,最终在改进算法的基础上编了实用软件,在实际磁共振成像系统中获得了应用。在现有的基于水模控制点几何校正算法的基础上,本文通过对实验设计、控制点提取算法和形变场估计算法进行优化,提出了基于水模成像和控制点的几何校正算法。本文提出的优化算法能够在较大范围内准确地估算形变场,并且能够自适应地利用水模数据估算形变场,进而校正实际扫描图像,无需人工干预,实验结果表明,该算法可以获得良好的校正效果。针对磁共振图像中存在的图像灰度不均匀的问题,本文基于多项式表面拟合的灰度校正方法方法以及FCM等算法的研究,对现有的算法进行了改进,得到了较好的校正效果。