南海海绵可培养共附生真菌种群多样性的研究及PKS功能基因的筛选

来源 :哈尔滨商业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hnbc2008
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采用4种不同的真菌培养基,对我国南海海域的可培养海绵共生真菌进行分离培养。利用分子生物学手段,扩增ITS片段进行系统发育树的分析,并利用简并引物对PKS功能基因进行筛选。利用滤纸片法进行大肠杆菌(E.coli、枯草芽孢杆菌(Bacillus sp.)等四种细菌进行抑菌活性的初步筛选。实验结果显示:分离得到可培养真菌151株,扩增了 18S rDNA片段,用三种内切酶进行酶切后,得到24种类型,综合真菌形态学观察等因素,我们挑选出15株代表真菌,它们分属于子囊菌门 Ascomycota 下属的Xylariales、Sordariales、Pleosporales 等 8 个目,14 属。而所有151株海绵来源真菌中,球腔菌科的枝孢霉属(Cladosporiunm),占总数的19.2%,丛梗孢科的曲霉属(Aspergillus)真菌占7.8%。这两种真菌在海绵中是绝对的优势种群。除了此之外还发现了Pestalotiopsis sp.Geosmithia sp、等。其中,XSA-10-24 经 blast比对,与现有菌种相比相似度低,可能是新种。利用PKS分子探针进行筛选。得到14条800bp大小的片段,经测序比对。其中XSA-07-2与Aspergillus terreus at1 gene最为相似,但是在重合度为85%时的相似度仅86%。与之前报道有差异,具有一定的新颖性。经测序,这些PKS基因都属于Ⅰ型PKS,很多Ⅰ型PKS基因负责合成抗菌物质,因此具有很好的研究价值。在抑菌实验中,在所有待检测样品中,共有7株真菌对1种及以上的指示菌表现出了抑制活性。XSA-47-10、XSA47-10和XSA-47-22三株真菌的粗提物对于枯草芽孢杆菌、素云金杆菌以及金黄色葡萄球菌表现出一定的抑制作用。而XSA-09-1对枯草芽孢杆菌和苏云金杆菌,有一定抑制作用。本研究推测海绵中的微生物在海绵的化学防御过程中,起到了重要的作用。具有药物开发潜力和特殊的生态学意义。
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