大白菜CBF冷应答途径中基因的克隆及其表达分析

来源 :兰州大学 | 被引量 : 8次 | 上传用户:lkekej1314
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拟南芥CBF转录因子是冷应答途径的关键成员,它位于冷应答调控网络的节点上,一个CBF转录因子能激活下游众多与抗逆有关的功能基因的表达。虽然植物中存在多条冷应答途径,但目前对CBF途径的研究最为深入,功能最确切,所以其中的基因是植物抗寒分子育种的首选目标。本研究以大白菜为实验材料,通过同源克隆的方法,从冷处理的幼叶中分离到CBF冷诱导途径几个关键成员的基因:对它们进行了序列分析和功能预测,不同处理条件下的基因表达模式和转录调控关系的研究,内容概括如下: 1.用PCR方法从大白菜中分离出COR-like基因的编码区,命名为BcCOR。该基因编码129个氨基酸的小分子蛋白。亲水性预测表明该蛋白富含亲水氨基酸残基,是一种高度亲水的蛋白质,同时推测BcCORN端的1/3区域与叶绿体定位转运肽的序列极其相似。BcCOR蛋白二级结构主要以丰富的α-螺旋(72.87%)和无规卷曲(17.05%)两种形式出现。这些特点与拟南芥AtCOR15a蛋白的结构特征一致;BcCOR与拟南芥AtCOR15a的核苷酸相似性为80.2%,氨基酸上的同源性71.4%,说明通过兼并引物克隆得到的基因属于COR基因家族,推测BcCOR具有与AtCOR15a相似的抗寒功能。 2.RNA杂交实验显示,冷和脱水处理均能以相似的模式诱导BcCOR的表达,并且与已报道的拟南芥AtCOR基因转录谱基本一致,说明相同家族的基因具有表达和功能上的普遍性;但BcCOR基因的表达又具有自身的特殊性。一方面表现在BcCOR基因对脱水处理没有冷处理敏感,这可能与该基因上游调控序列中不同种顺式元件的多寡及活性有关。另一方面与拟南芥AtCOR不同的是,外源ABA不能诱导BcCOR的转录积累,这种同源基因表达模式的差别提示它们存在功能上的多样性。 3.用兼并引物从冷诱导的大白菜(Brassica pekinensis)中克隆出两个CBF/DREB1类基因,分别命名为BcCBF1、BcCBF2。序列分析显示,各编码蛋白含保守的AP2型DNA结合域,N末端核定位信号,C末端酸性激活区及CBF/DREB1蛋白特征序列,与拟南芥CBF/DREB1类转录因子有很高的同源性。 4.mRNA积累特性表明,BcCBF1、BcCBF2均能被低温在短时间内强烈诱导,
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