无乳链球菌分子分型与重组研究

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hfwandy
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:荚膜多糖(CPS)基因和菌毛岛基因是无乳链球菌(GBS)的重要毒力因子。本研究旨在探究GBS中CPS基因和菌毛岛基因的分子分型特征,并探讨其与基因重组以及菌株致病表型(侵袭性)之间的关系。材料和方法:对21株临床GBS菌株进行全基因组测序,并从NCBI公共数据库下载了已经公开发表的995个GBS基因组。进行了多位点序列分型(MLST)和种群结构的贝叶斯聚类(BAPS)分析,并构建了系统发育树。基于全基因组序列建立基于局部比对算法的搜索工具(BLAST)数据库,对CPS和菌毛进行分子分型。定义系统发育与CPS和菌毛分型结果之间的不一致为重组。根据菌株来源信息判定定植性侵袭性。结果:GBS中MLST的7个基因未发现重组,ST17型(9.1%)最主要的。所有的CPS分型和菌毛分型结果与MLST和BAPS聚类基本一致,CPS Ⅱ型(24.6%)和PI-1+PI-2a型菌毛岛(39.2%)是最主要的。但CPS基因和菌毛岛基因仍存在重组现象。CPS Ⅱ型以及菌毛岛PI-1+PI-2b型和PI-2a型的GBS分离株比其他分离株更易发生重组。CPS Ib型和Ia型以及菌毛岛PI-1+PI-2a类型的分离株最不容易发生重组。CPS Ib型和菌毛岛PI-1+PI-2a型在定殖菌株中比较常见,而PI-2b型更容易在侵袭性菌株中出现。对于CPS V型,定植性菌株更容易出现重组;而对于CPS Ⅲ型,则相反。结论:本研究发现CPS Ⅱ型和菌毛岛PI-1+PI-2a型是最主要的分型;CPS Ⅱ型以及菌毛岛PI-1+PI-2b型和PI-2a型的GBS分离株更容易发生重组;菌毛岛PI-2b型更容易在侵袭性菌株中出现;CPS V型的定植性菌株更容易出现重组。这有助于指导控制感染和开发预防GBS发生的新疫苗。
其他文献
摘要:基于DesignBuilder和EnergyPlus软件,以成都地区白天室外最高温分别为30℃和32℃为代表日,采用相变材料结合夜间通风技术对室内热环境的影响进行了模拟,分析了房间的墙体结
火灾和可燃气体危害是过程工业生产过程中存有的典型危害。因此,在相关生产装置安装用于检测,某些情况下能够自动减缓危害的火气系统是非常有必要的。火气系统(Fire and Gas
对泡沫混凝土孔结构与强度的内在关系进行了研究,运用IPP分析和统计学分析找到影响因子Fn,并得到泡沫混凝土的强度与影响因子Fn的模型方程:f/fc,o=(1-Fn)。
通过“一步法”和“模塑发泡法”制备了一种新型含聚磷酸胺硬质阻燃聚氨酯保温材料(P/RPUF)。通过表观密度、水平垂直燃烧、极限氧指数(LOI)以及热失重分析(TGA)等对其阻燃性能进行