在经济和信息日益发展迅猛的环境下，组织在各个方面面临着很大的挑战，其中两个尤为明显：内部变革和人员流动。在这种形势下，组织既要保证吸引足够多的可以为之所用的人才，又要使员工愿意长久的为组织效力。因此，人与组织匹配引起了学术界和实践界的关注。本文应用自组织理论解释了知识型员工与组织匹配机制，将该机制看成自组织系统，紧紧围绕自组织系统发展的核心思想：从无序状态到静态有序状态再到动态有序状态，说明了知识型员工与组织匹配机制的发展趋势，从而解释了每个状态起主导作用的内部机制，在此基础上分析了知识型员工与组织匹配机制的动力模块、运行模块和调节模块。在动力模块中，为了探究影响知识型员工与组织匹配的因素，本文采用访谈法对相关从事人力资源工作的人员进行访谈，通过对访谈记录的分析，得出26个影响要素，然后对这26个要素进行划类整理得出了包括5个维度的8个影响因素，从而得出了知识型员工与组织匹配机制的动力因素作用模型。在运行模块中，通过文献研究总结出从匹配角度影响组织绩效的19个因素，通过专家法对每两个因素的关系进行确定，然后运用解释结构模型对这些因素的关系进行梳理，从而得出匹配是如何影响组织绩效的。在调节模块中，根据组织发展的不同阶段，分为成熟期前、成熟期后分别讨论了具体的调节策略，特别是对于互补性不匹配运用博弈论和替代效应分析了组合调节策略。以上对知识型员工与组织匹配机制的分析对于组织在实践中把握匹配具有指导意义。