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布依族、水族人群XRCC1基因单核苷酸多态性研究
目的:分析布依族、水族人群DNA修复基因XRCC1C26304T、G27466A与G28152A单核苷酸多态性及其等位基因频率与组合分布特征研究。
方法:获取自然人群个体布依族192例、水族197例血白细胞基因组DNA,利用PCR扩增限制性酶切法(PCR-RFLP)检测XRCC1C26304T、G27466A与G28152ASNPs。
结果:1.布依族:XRCC1C26304TSNPs基因型分布CC、CT、TT分别为64.6%、28.6%、6.8%。C、T等位基因频率分别为78.9%、21.1%。XRCC1G27466ASNPs基因型分布GG、GA、AA分别为85.9%、12.5%、1.6%。G、A等位基因频率分别为92.0%、8.0%。XRCC1G28152ASNPs基因型分布GG、GA、AA分别为55.2%、37.0%、7.8%。G、A等位基因频率分别为73.7%、26.3%。研究发现了XRCC1基因C26304T和G28152A两位点的SNPs组合基因型频率较高的为CC+GG60例(31.2%);C26304T和G27466A两位点的SNPs组合基因型频率较高的为CC+GG98例(51.0%);G28152A和G27466A两位点的SNPs组合基因型频率较高的为GG+GG88例(45.8%)。2.水族:XRCC1C26304TSNPs基因型分布CC、CT、TT分别为57.4%、33.5%、9.1%。C、T等位基因频率分别为74.1%、25.9%。XRCC1G27466ASNPs基因型分布GG、GA、AA分别为79.7%、18.3%、2.0%。G、A等位基因频率分别为88.8%、11.2%。XRCC1G28152ASNPs基因型分布GG、GA、AA分别为49.2%、43.7%、7.1%。G、A等位基因频率分别为71.1%、28.9%。XRCC1基因在C26304T和G28152A两位点的SNPs组合基因型频率较高的为CC+GA53例(26.9%);C26304T和G27466A两位点的SNPs组合基因型频率较高的为CC+GG84例(42.6%);G28152A和G27466A两位点的SNPs组合基因型频率较高的为GA+GG73例(37.1%)。
结论:本研究揭示了布依族、水族XRCC1基因3位点的单核苷酸多态性、基因型及其组合分布特征,为进一步研究该基因SNPs与其生理功能和疾病的关系提供基础资料。