【摘 要】
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目的:基于基因表达综合数据库和癌症基因组图谱数据集,以及10位病理标本的实验,发现ASPM在膀胱癌中显著过表达,进一步阐明证ASPM基因过表达与膀胱癌的侵袭性及预后不良的关系
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目的:基于基因表达综合数据库和癌症基因组图谱数据集,以及10位病理标本的实验,发现ASPM在膀胱癌中显著过表达,进一步阐明证ASPM基因过表达与膀胱癌的侵袭性及预后不良的关系。方法:从基因表达综合数据库(Gene expression Omnibus,GEO)和癌症基因组图谱(cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中,共收集到6个独立的全球膀胱癌微阵列mRNA表达数据集(n=1355),以及10位就诊于东阳市人民医院膀胱癌患者,收集患者年龄、性别临床分期、病理标本等并通过人类伦理委员会批准及病人知情同意,分析10位患者膀胱癌组织标本中ASPM的表达情况。结果:1:从基因表达综合数据库(Gene expression Omnibus,GEO)和癌症基因组图谱(cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中,共收集到6个独立的全球膀胱癌微阵列mRNA表达数据集(n=1355),这些数据具有临床和随访意义。2:RT-qPCR分析显示,在10对人类组织样本中,膀胱癌组织中ASPM mRNA的表达高于邻近正常膀胱粘膜(P=0.004)。ASPM在膀胱癌组织中的高表达与GEO和TCGA的mRNA表达数据一致。3:基于GEO和TCGA数据集的膀胱癌分级和肿瘤淋巴结转移(TNM)分期的相关性(P<0.05)。基于GEO和TCGA数据库(p<0.05)的生物信息学分析表明,ASPM表达与膀胱癌分级和肿瘤淋巴结转移(TNM)分期(P<0.05)ASPMmRNA有着重要的关系。:4:分层分析显示,ASPM在低分化或乳头状亚型膀胱癌中的临床意义尤为显著。Cox和Kaplan-Meier联合分析表明,膀胱癌中ASPM表达与整体(OS)不良和无进展生存(PFS)显著直接相关。多变量和分层分析表明,ASPM的预后意义在低级别或乳头状膀胱癌中是明显的,但在高级别或非乳头状膀胱癌亚组中不明显。ASPM表达的增加与肌肉浸润性膀胱癌中OS表达不良及非肌肉浸润性膀胱癌中PFS表达较差有关(户<0.05)。5:生物信息学分析在STRING-DB.org网站数据中发现了 11个与ASPM相关的基因。其中大部分基因的表达与膀胱癌预后不良相关,具有统计学意义。基因集富集分析表明,ASPM的高表达可富集膀胱癌有丝分裂、分化和转移相关基因特征。TCGA数据集进一步分析显示,ASPM表达的增加与前列腺癌Gleason评分升高、T期、N期显著相关,且临床疗效较差。肾细胞癌TNM晚期和PFS较差也与此相关。结论:在低度和乳头状组织学亚型中,ASPM过度表达与膀胱癌侵袭性显著相关,ASPM有望成为膀胱癌预后预测的生物标志物和潜在的治疗靶点。
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