江苏地区猪博卡病毒的检测与分子流行病学调查

来源 :南京农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zhangliu2009
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博卡病毒是近几年被发现的一种人、猪、牛、犬、猩猩等多种哺乳动物共患的新型DNA病毒。2009年,从患有断奶仔猪多系统衰竭综合征的猪淋巴结中发现了一种单股线状DNA病毒,即猪博卡病毒(Porcine bocavirus,PBoV)。后续的研究发现,博卡病毒在国内外猪群中广泛存在,可能是引发仔猪腹泻病的一个重要原因。因此,开展PBoV的研究具有重要意义。本实验根据GenBank收录的猪博卡病毒核苷酸序列,设计一对特异性引物,建立一种能检测猪博卡病毒的PCR方法,并对该方法进行特异性试验,敏感性试验,重复性试验和可靠性试验。结果显示:本实验所建立的PCR检测方法与猪伪狂犬病病毒(PRV)、猪圆环病毒2型(PCV2)、猪细小病毒(PPI)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)无交叉反应,特异性强;可以检测的最低为6.2×10-9ng/μL,敏感度高;经5次重复检测,结果一致,重复性好;经测序,阳性PCR产物与GenBank公布的猪博卡病毒核苷酸序列一致,可靠性强。用本实验建立的PCR方法对来自江苏6个地区的242份样品进行了检测,其中34份为猪博卡病毒阳性,证明了在江苏地区存在PBoV的感染情况。选取其中18条阳性产物进行测序和生物信息学分析。结果发现,PBoV阳性病料检出率为14%(34/242);与GenBank上收录的其他13株博卡病毒核苷酸相似性在34.6%~100%之间。系统进化树分析发现,这些博卡病毒可分为4大分支,本实验获得的18条序列和NC024453位于一支。说明江苏地区猪博卡病毒感染率较高,且进化关系比较复杂。
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