改革开放以来,我国经济迅猛发展,高等教育体制改革不断深入,国家对教育经费投入大幅增加,高校的资金来源渠道和办学形式变得多样化,这使得高校财务的经济业务领域和服务对象变得日趋复杂。然而,由于内部控制风险意识淡薄、方法缺失等原因,高校财务风险日益增高。近几年高校腐败犯罪、职务犯罪案件频发。完善的高校财务内部控制制度是学校健康长远发展的保障。新形势下,迫切需要完善和健全符合我国高校实际的财务内部控制制度,促使经济活动遵纪守法,财务信息完整有效。本文结合我国高校教育发展现状,对当前高校财务内部控制管理体系进行梳理和分析,提出研究意义、研究内容,运用文献分析法、实地调查法、逻辑推演法等进行探索研究。选用H高校为研究对象,在国内外文献和相关理论研究的基础上,参照《行政事业单位内部控制规范（试行）》、高校内控指标考核指南等指导要求,通过制度解构,从单位层面和业务层面对H高校财务内部控制建设进行分析,查找出H高校财务内部控制存在内部监管力度不足、缺少风险评估机制、信息沟通不对称等不足之处。对于这些薄弱环节,有针对性地提出完善建议和保障措施,以降低经济业务运行风险,提高业务运行的效率。高校的财务内部控制应该由两个不同的层面组成:单位层面以及业务层面。并定期通过量化指标评估财务内部控制的有效性,防微杜渐,将事后管理转变为实时全程控制,不断完善内部控制体系。希望能为其他高校的财务内部控制工作提供一些有效借鉴,为其他高等学校长远有序发展提供实践参考作用。