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本研究利用特异性引物A、B和5个限制性内切酶，对包括滩羊、湖羊、小尾寒羊、阿勒泰羊等在内的8个我国主要地方绵羊品种、2个引进品种，进行了mtDNA D-loop区的PCR-RFLP分析；并利用10个10碱基的随机引物，对这8个地方绵羊品种的基因组DNA样品进行了RAPD分析。研究结果表明：(1)五种限制性内切酶(Hinf Ⅰ、Msp Ⅰ、Sau3A Ⅰ、Xsp Ⅰ、Taq Ⅰ)在对绵羊mtDNA D-loop区的PER-RFLP分析中均表现出多态，共检测到22个酶切位点、17种限制性态型；17种限制性态型被归结为14种单倍型。(2)所试群体存在两种基本单倍型，单倍型A(Hinf Ⅰ-A、Msp Ⅰ-A、Sau3A Ⅰ-A、Xsp Ⅰ-A、Taq Ⅰ-A)和单倍型B(Hinf Ⅰ-A、Msp Ⅰ-A、Sau3A Ⅰ-A、Xsp Ⅰ-B、Taq Ⅰ-A)；绵羊品种间mtDNA D-loop区的分子聚类将受试群体明显的聚为两类，利用RAPD技术所得的基因组DNA分子聚类亦将受试群体聚为两大类，其中藏绵羊和蒙古羊被分聚在不同的类内；初步认为我国地方绵羊品种具有两种不同的母系起源，起源于两个不同的野生祖先。(3)我国绵羊品种基因组DNA具有丰富的遗传多样性(多态位点百分率为81.36％、群体平均遗传多样性指数为1.3370)，且遗传变异主要存在于群体间(Gst=0.9172)。(4)具有相同来源的蒙古羊、乌珠穆沁羊、小尾寒羊和湖羊4个地方绵羊品种间已经有了明显的遗传分化，小尾寒羊、乌珠穆沁羊间遗传分化较低，湖羊与蒙古羊之间相对较高，而小尾寒羊和乌珠穆沁羊与湖羊和蒙古羊之间的遗传分化最高。(5)藏绵羊、乌珠穆沁羊和蒙古羊mtDNA D-loop区的基因单倍型较单一；滩羊、小尾寒羊、藏绵羊和蒙古羊4个地方绵羊品种的群体遗传多样性程度较低。(6)单倍型Ⅰ(Hinf Ⅰ-C、Msp Ⅰ-A、Sau3A Ⅰ-A、Xsp Ⅰ-B、Taq Ⅰ-A)将8个我国地方绵羊品种和2个欧洲引进品种明显分开，其有可能为欧洲绵羊品种所特有的单倍型。(7)首次对中国地方绵羊群体mtDNA D-loop区PCR-RFLP分析的P值为0.0322、π值为0.0060％。