Graves病易感基因-CTLA4在中国汉族人群中的易感性研究

来源 :上海交通大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lanke0022
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本文对Graves病易感基因-CTLA4在中国汉族人群中的易感性进行了研究。弥漫性甲状腺肿伴甲亢(Graves’Disease,简称GD)是一种常见的自身免疫甲状腺疾病,由于机体产生了针对甲状腺激素受体的自身刺激性抗体(TRAb)导致甲状腺功能亢进,并伴有T/B淋巴细胞激活及抗原识别和递呈的调节紊乱。遗传因素在其中发挥着重要的作用,为了更好更全面地认识遗传因素在GD的作用,我们选择了1536个GD患者和1516个正常对照进行了全基因组关联研究(GWAS)。分析发现2q33区域可能是其中一个GD易感区段,在该区段内包含有三个基因,分别为CD28、CTLA4、ICOS,病例-对照分析的结果显示在该区段内有一串连续分布P值非常显著的单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)位点,其中有6个SNP位点的P值<1×10-4,而最显著的位点是rs1024161 P值达到4.39×10-8。为了明确2q33区段是否就是一个GD的易感区段,我们在该区段又选择了三个SNP位点(rs1024161, rs231726, rs10197319)做进一步的验证。在扩大样本的中国汉族人群中(3994个GD患者和3510个正常对照)所有验证的位点都显示显著性差异,它们的P值都分别达到了7.41×10-11(rs1024161), 2.67×10-9 (rs231726)和 4.24×10-5 (rs10197319)。综合GWAS的结果,我们非常肯定2q33区域是一个GD的易感区段。进一步的研究发现,GD易感区段2q33的P值显著SNP位点都集中在CTLA4基因区,因此我们对该区域进行了精细定位。在2640个GD患者和2204个正常对照的样本中我们总共选择了47个SNP位点进行基因分型,囊括了整个CTLA4基因区域。经过严格的质量控制,我们发现2/3的SNP位点在病例-对照研究中有显著性差异(P<0.05),充分肯定了CTLA基因就是GD的易感基因,且深入的统计分析提示SNP rs231779 (等位基因P=2.81×10-9, OR = 1.35, 基因型P= 2.75×10-9, OR = 1.42)极有可能是GD的一个易感位点。
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