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长序榆(Ulmus elongata L.K Fu et C.S Ding)为榆科(Ulmaceae)榆属(Ulmus)植物珍稀濒危树种,属国家二级保护植物。由于自然因素影响和人为活动加剧,近年长序榆分布范围缩小、生境破碎化加剧,遗传漂变现象严重,物种濒于灭绝。因此从保护物种多样性角度出发,保护这一珍稀濒危物种刻不容缓。本文对采自全国3省市的5个居群67个样本开展ISSR分子标记分析,通过用8个lSSR引物对长序榆DNA进行扩增,所得条带经POPGEN 32分析,结果显示:长序榆遗传多样性处于较低水平,且主要遗传分化源于居群内部。其中古田山居群(G)遗传多样性水平最高,PPB=78.5%,I=0.5177,Hs=0.3493,Ht=0.3486;松阳何山头长序榆居群(H)遗传多样性水平最低PPB=67.3%,I=0.4430,Hs=0.4056,Ht=0.3854。浙江省内居群间遗传多样性水平比浙江省外高。5个长序榆居群间各位点平均Ht为0.4221,居群内平均Hs为0.3262,居群间平均遗传分化系数Gst=0.2271,说明其居群间遗传变异程度达22.71%;各居群间平均基因流Nm=0.7015,表明长序榆居群间的基因交流程度有限。这可能和其居群生境面积大幅缩减、生境破碎化严重、地理隔离加剧导致居群间基因交流不畅而倾向于依赖居群内部进化有关。建议对长序榆自然居群以就地保护为主,并增强群体间的基因流流动频率,最大限度地保存其遗传多样性。