太白山溪鲵（B.taibaiensis）是宋鸣涛2001年在陕西秦岭地区发现的山溪鲵属的新种,模式产地西安市周至县厚畛子镇花儿坪。近几年对太白山溪鲵在秦岭的分布问题存在诸多争议。秦岭横贯中国中部,是我国地理上的南北分界线、黄河和长江的分水岭。在动物地理区划上,该区域是古北界和东洋界的分隔区。因此在秦岭地区南北两侧不同区域的相同物种的不同居群之间,分子和形态上会存在一定的差异。作者在2008年11月-2009年8月分别从秦岭的北坡：太白山溪鲵的模式产地周至县厚畛子镇花儿坪村、周至县板房子村,到秦岭的南坡：宁陕县旬阳坝镇平河梁,这3个地点采集到了21尾太白山溪鲵样本。本文结合了形态学和分子生物技术手段对3个采集点采集的样本进行系统的统计分析,得出下结论：（1）控制区序列和Cytb基因进化均较快,并且控制区序列要快于Cytb基因。控制区序列变异位点较多,碱基已经达到饱和,颠换值大于转换值。但由于控制区序列本身并非蛋白质编码区,变异频率要比蛋白质编码区的Cytb基因要高,很难确定其碱基的插入和缺失,所以要结合进化快又是蛋白编码区的基因序列共同进行分析,分析结果更有可信度。本文采用了控制区序列和Cytb基因序列相结合的分析方法。（2）通过控制区序列和Cytb基因构建的系统发育树分析来看,三个居群除平河梁居群PHL7外遗传距离均在0-0.036之间,为种下遗传距离。且在周至居群和平河梁居群间进行遗传距离比较后发现在两个居群间遗传距离比居群内的遗传距离大。两个基因均支持把太白山溪鲵分为2类,一个是秦岭南坡的平河梁居群,一个是秦岭北坡的周至（包括板房子和厚畛子）居群。其中平河梁居群的PHL7可以看做是隐存种存在。（3）形态学数据分析同时支持了将太白山溪鲵以秦岭为界分为2类的观点,也支持平河梁居群的PHL7为隐存种的观点,它与平河梁居群的其它个体在形态差异上不显著,符合太白山溪鲵种的各个体征。（4）文中数据通过对3个地点太白山溪鲵的系统发育分析、形态特征、和其生境的分析,从一定的程度上反应了秦岭的高大山脉对太白山溪鲵的这3个地理种群的地理阻隔作用,虽然北坡的2个居群间遗传分化程度不高,但南北坡间有较大的遗传距离。