畜牧业纵向一体化投资项目是我国畜牧业投资领域中出现的越来越多的一种形式。它是指企业直接投资于畜(禽)育种、养殖、饲料加工、屠宰、畜(禽)产品深加工、产品销售等产业链上的多个环节，或是投资于其中的一个环节，但这个环节与投资企业内部原有的生产环节构成了一体化产业链条。这类多环节、长产业链条的纵向一体化投资项目，资金占用量大、涉及范围广、不确定因素多，一旦出现决策失误，不仅为会给出资方带来巨大损失，对地方畜牧经济发展带来不可估量的损失。因此，在对这类项目进行投资决策时应该更加审慎。 但是，在当前投资体制改革的大环境下，我国沿用的以政府视角进行项目评价方法和指标体系广遭诟病，且国内沿用的主要针对工业的单一环节项目的评价方法和指标体系，在评价畜牧业纵向一体化项目中存在极大的不适应性，亟待改进。 本文认真研究了国内外项目纵向一体化发展理论、项目评价的方法和理论，结合新形式下不同用户对畜牧业纵向一体化投资项目的评价指标需求和这类项目的特点，并在大量实际案例研究的基础上，提出改进的评价方法和指标体系，使其更具科学性和针对性，为提高投资决策水平服务。 重新构架的总评价指标体系包括两类，一类是政府评价视角的社会效益综合评价指标体系，评价重点关注的是项目的外部性，应用的主要方法是层次分析方法(AHP)和模糊数学分析方法；另一类是企业投资者视角的基于产业链整体效益最大化的综合评价指标体系，重点关注的是产业链整体绩效最大化及通过产业链设置来规避市场风险。应用的主要方法是贴现现金流(DCF)、NPV法和决策树(DTA)等分析方法的的综合利用。 本论文的创新点主要体现在以下方面： 1、利用相关理论，对畜牧业投资纵向一体化项目的内涵进行了界定，对其特征进行了探讨，并结合我国投资体制改革的需求及畜牧投资纵向一体化项目特性，提出不同用户评价指标体系需求； 2、总结评价了传统投资项目评估方法的缺陷，提出了改进方向，创新畜牧业纵向一体化投资项目评价理念 3、提出畜牧业纵向一体化产业链评价方法和指标体系，并通过实际案例分析计算，对新评价指标体系的运用的条件做出分析说明，对指导类似项目评估有参考价值。