《新疆生产建设兵团国民经济和社会发展第十一个五年规划》中指出,兵团农产品加工业产值与农业产值要达到0.8：1,而国外发达国家目前的比值已达到3-4：1,国内的比值为1.2：1。兵团农产品加工业水平低,附加值低已严重影响了兵团农产品加工业和团场职工收入增长。学者们也意识到了农产品加工业问题的重要性,并从诸多角度对我国农产品加工业进行了研究。本文从兵团农产品加工业的组织模式和运行机制的视角,运用农业产业化理论、产业链理论、契约理论、博弈理论等理论对兵团农产品加工业的组织模式和运行机制进行研究,以期达到以下目的：第一,探讨兵团农产品加工业存在的问题；第二,分析兵团农产品加工业现有的组织模式,探讨适合兵团农产品加工业发展的组织模式；第三,分析兵团农产品加工业的运行机制,寻求优化兵团农产品加工业的运行机制的新途径,为促进兵团农产品加工业的发展和团场职工增收提供政策依据。本文在重新界定农产品加工业概念的基础上,分析了兵团农产品加工业的发展状况,并对其组织模式和运行机制进行了分析,结果认为“农产品加工企业+农户”和“农产品加工企业+中介+农户”这两种组织模式,现已成为兵团农产品加工业的主流。但由于各地区资源条件、经济发展状况不同,应结合本地区的产业结构特征,选择适合本地的组织模式。通过对从契约机制、委托代理机制和博弈机制这三个方面的分析,认为兵团农产品加工业存在“柠檬”问题、“违约”问题和“信息不对称”问题。在此基础上,提出如下政策建议：1.创新农产品加工业产业组织模式；2.加强“行业协会”等中介组织的职能；3.提高兵团农产品加工企业与农户之间的关联度：一是增加专用性资产投资,强化农产品加工企业与农户之间的相互依赖性；二是引入期权理论中的卖权机制,进行制度创新；三是提高契约双方的违约成本,降低其违约效益,强化合约管理；4.克服农产品加工业中柠檬市场的策略：一是质量保证书和商标策略；二是产品质量标准控制策略；三是培育市场中间商和经纪人的策略。5.优化兵团农产品加工业运行机制：一是提高农业组织化程度；二是提升团场职工综合素质；三是增强订单农业中企业与农户之间利益联结度；四是加强信用制度建设。通过本文的研究,其创新点主要有以下两点：1.对农产品加工业进行科学界定和分类。突破了以往对农产品加工业概念的限制,从原料投入的多数性和加工品的最终形态应保持农产品的基本性状方面对农产品加工业的概念进行了重新界定,并在现有农产品加工业分类的基础上对农产品加工业进行了新的分类。2.对兵团农产品加工业的组织模式和运行机制进行研究。目前为止,学术界对兵团农产品加工业的研究很少,更没有人研究过兵团农产品加工业的组织模式和运行机制。本文分析了兵团农产品加工业的组织模式类型,并重点从契约机制、委托代理机制和博弈机制三个不同的角度剖析了兵团农产品加工业运行中存在的问题,如“柠檬”问题、“违约”问题和“信息不对称”问题,并分析了其成因。