核糖体管道对蛋白质折叠过程影响的研究

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蛋白质在很多生命活动中都起到了非常重要的作用,蛋白质折叠过程的研究更是当前生命科学领域的重要研究课题之一。使用计算机模拟的方法在蛋白质等生物大分子的研究中已经得到了广泛应用。  为了研究核糖体管道在蛋白质折叠过程初期扮演的角色,本文使用全原子模型,选取维林蛋白头片域(即HP35蛋白,蛋白质编号:1yrf)为研究对象,进行了其折叠过程的分子动力学模拟运算。本文共进行了两组模拟,其中包括在管道中进行了预折叠的实验组以及完全在自由空间进行折叠的参照组。最终经过两组结果对比,我们发现,在管道中进行预折叠可以有效加速蛋白质形成天然二级结构的过程。此外我们的试验结果还表明,从核糖体管道中折叠过的蛋白质被释放到自由空间下时,会比一直在自由空间下进行折叠的蛋白质更容易形成蛋白质结构的天然片段,这样蛋白质就会更快的趋于稳定,也极大减少了需要对构象取样的空间。
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