随着我国经济的快速发展，对外贸易增长迅速，国际交往愈加频繁，国内经济体制改革不断的深入和完善，中国海关也面临着新的发展要求。海关信息系统战略规划成为海关现代化建设重要的组成部分。本文通过对信息系统战略规划理论、业务流程再造理论和海关风险管理理论的介绍进一步讨论在现代海关制度第二步发展战略下，海关核心业务流程的风险式再造，以及在此基础上进行的现代海关信息系统战略规划的研究和探索。主要内容包括： 信息系统战略规划理论部分介绍了信息资源管理理论、IT治理理论和信息系统战略规划的三个发展阶段，在介绍信息系统战略规划理论后，引出了战略一致性模型。业务流程再造理论部分阐述了BPR的核心思想是过程管理，要求打破组织部门间的界限。海关风险管理理论部分介绍了风险、风险管理、海关风险和海关风险管理理论的概念，并说明了WCO对风险管理基本程序的定义。 着重阐明海关总署提出的现代海关第二步发展战略及与海关第二步发展战略相匹配的海关信息化发展战略。介绍了在传统条块分割的海关职能组织结构基础上建立风险管理组织机构的情况以及由此产生的问题，并提出了与海关发展战略相适应的风险管理组织结构的设想。 海关的传统通关管理模式及在我国现阶段海关风险管理机制下海关通关管理模式的改革方向和海关风险管理应用的框架。并提出了海关与风险管理体系组织结构相适应的风险管理运作机制下业务环节的风险式流程设计。 海关现有的信息系统架构以及海关信息系统规划存在的问题。通过海关总署和直属海关两个层面对信息系统架构的探索，以及分析这种架构存在的问题，提出笔者对基于风险管理机制的海关信息系统架构的设想。健全完善海关信息系统战略规划制度体系，使每个环节、每个部门乃至每个人清楚明白该“做什么”，“如何做”，“做得怎么样”的问题。以及在高层的支持下，调动各种支持手段，不断完善各类基础配套措施，切实加强人、财、物的基础保障能力，满足海关信息系统战略规划实施的需求。