玉米幼苗胚芽和胚根基因表达差异的研究以及ZmCDC5基因的克隆

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为探索玉米种子萌发的分子机制,该试验从玉米发育的最初时期-种子萌发期开始,运用mRNA差异显示方法比较了玉米品种"农大3138"萌发48小时胚芽和胚根中基因转录水平的差异,并对差异表达的cDNA片段克隆分析.全部12种3锚锭引物和10种5随机引物构成的120个引物组合中,有40个引物组合可以扩增出差异条带,其中以GA、AG、GG、AT结尾的锚锭引物扩增效果较好.从这40个引物组合得到的差异条带中,选取87条介于300bp-1500bp之间、差异明显的cDNA条带,用反向Northern方法验证.选取以上经反向Northern验证的8个片段进行克隆测序,然后在GenBank中进行同源性比较.依据片段MF12推测的氨基酸序列与CDC5家族成员同源性,运用RACE方法分离到包含有全部编码区的玉米CDC5基因,全长为3188bp,在玉米基因组中为单拷贝.ZmCDC5基因在玉米不同组织中的转录量因不同发育时期而异.ZmCDC5基因编码的蛋白质由925个氨基酸组成,在N端有两个完整的Myb重复区,紧接着Myb重复区的下游有一个类似Myb重复区的MRL3区域;在整个氨基酸序列中分布着许多丝氨酸/苏氨酸激酶的磷酸化位点.ZmCDC5蛋白与AtCDC5蛋白的同源性最高,与其余C端同源性逐步降低的规律.以上分析结果表明本实验分离到的ZmCDC5基因编码的蛋白属于CDC5家族,人有与CDC5家族成员相似的功能,在玉米mRNA前体剪接和细胞循环中起作用.
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