采用中心产区典型群随机抽样方法和多种电泳技术检测60只小尾寒羊、73只滩羊编码血液蛋白17个结构基因座上的变异，引用国内外14个绵羊群体相同资料进行比较分析，探讨其遗传分化关系。研究表明：(1)小尾寒羊、滩羊结构基因座平均杂合度分别为0.2360和0.2587：平均多态信息含量分别为0.1974、0.2102；平均有效等位基因数分别为1.5723和1.5751。(2)4个组合(分别为4个、6个、13个及16个绵羊群体)的基因分化系数分别为0.049323、0.059987、0.1728和0.201256，说明湖羊、同羊、小尾寒羊和滩羊4个绵羊群体结构基因座的基因分化程度低；这4种绵羊与蒙古羊群体间基因分化程度次之；蒙古羊系绵羊和南亚羊及欧洲羊之间遗传分化程度较高。(3)前人关于小尾寒羊、滩羊由蒙古羊分化而来的考证得到遗传学实验的进一步证明，湖羊、同羊、小尾寒羊和滩羊受蒙古羊血统的影响递减。群体间亲缘关系远近与其所处地理位置远近并未表现出紧密相关。 以小尾寒羊、滩羊为材料，检测7个微卫星位点的遗传多态性，并引用湖羊、同羊及长江三角洲白山羊(参照群体)相同资料进行群体遗传分化水平分析。研究表明：(1)小尾寒羊、滩羊7个微卫星位点平均杂合度分别为0.9336和0.9116；多态信息含量与杂合度平行变化：平均有效等位基因数分别为16.4532和11.6884，表明小尾寒羊在非编码区的遗传变异程度高于滩羊。(2)4个绵羊群体7个微卫星位点基因分化系数为0.026329，绵山羊群体则为0.039036，表明绵羊群体间及绵山羊群体间基因分化程度较低。(3)7个微卫星标记分析表明湖羊和同羊、滩羊和小尾寒羊亲缘关系较近，后者关系需要进一步研究。(4)相对进化距离(RED)可定义为:1与同物种群体间模糊聚类置信水平值(入n)的差值和1与近缘物种参考群体、同物种总群体模糊聚类置信水平值(人)的差值之比值。湖羊和同羊的相对进化距离为0.253:小尾寒羊和滩羊的相对进化距离为0.407;湖羊、同羊和小尾寒羊、滩羊的相对进化距离为0.462。 以中心产区典型群随机抽样方法获得的小尾寒羊、滩羊、湖羊与同羊13个结构基因座、7个微卫星位点基因频率分布为研究对象，进行比较分析，尝试探讨群体间遗传分化关系。结果表明:(l)微卫星各位点的杂合度、多态信息含量、有效等位基因数及其平均值均高于结构基因座的相应指标，微卫星标记揭示的群体变异水平较高:基于微卫星标记的群体间标准遗传距离高于结构基因座的相应值;微曰己位点雄因频率资料计算的总位点基因分化系数低于结构基因座的相应指标，1洋体间基因分化水平总体上较低;两层次基因频率模糊聚类分析揭示的群体间关系不完全一致，相异之处有待进一步验证。(2)结构基因座和微卫星位点两层次基因频率资料的综合分析得出的结果没有与既有研究报道、文献一记载及本研究单层次基因频率资料分析相吻合，需要进一步深入研究探讨。