前列腺相关生活方式数据库构建及应用

来源 :苏州大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:caoerduo
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在欧美发达国家,前列腺癌居男性肿瘤发病率首位。但近期的研究表明,美国前列腺癌的年龄调整死亡率呈下降趋势。这种不断降低且相对较低的死亡率得益于公众对早期预防和治疗认识的提高。自2000年以来,随着人口老龄化和生活方式的改变,我国前列腺癌发病率的平均年增长率为12.6%,病死率也在持续增长,严重威胁我国男性健康。2019年6月24日印发实施的《国务院关于实施健康中国行动的意见》,倡导从以治病为中心转变为以人民健康为中心,建立健全健康教育体系,普及健康知识,引导群众建立正确健康观,加强早期干预,形成有利于健康的生活方式、生态环境和社会环境,延长健康寿命。本研究开展的生活方式知识的循证转化与疾病研究主流方向及国家健康政策相契合,具有明确的理论基础和现实意义。通过对慢性病、癌症及前列腺癌与生活方式最新研究动态的系统综述发现,目前生活方式研究没有统一的标准和参照,数据异质性较高且分类多样,很多生活方式对前列腺癌发生的影响在不同研究中的结论相互矛盾,难以共享于系统研究或辅助临床生活方式决策及病人的自我健康管理。本研究通过系统循证的方法构建了前列腺癌生活方式数据库(The PCa-related lifestyle database,PCaLiStDB),全面整合前列腺癌发生相关的生活方式,涵盖饮食、营养、生活习惯、社会和环境因素以及相关的基因和生理生化指标、疾病的表型和药物。当前PCaLiStDB1.0版收集了 2290种生活方式单因素作用和365种两种或两种以上生活方式的联合作用。其中发挥保护作用的生活方式有394个、危险作用556个、无影响作用45个、观点相矛盾的52个。PCaLiStDB循证地将前列腺癌生活方式研究进行全面定量的研究与分析,为后续生活方式的全局研究、标准构建及机制研究提供了数据平台。前列腺癌全生活方式关联(Lifestyle-Wide Association Studies of prostate cancer,PCa-LWAS)对PCaLiStDB中的11973个生活方式单因素作用和3624个两种或两种以上生活方式的联合作用进行深入地挖掘与分析,找出54个联合危险因素、34个联合保护作用、219个联合矛盾作用、652种不明确联合作用,并将前3种关系进行可视化网络分析。同时将PCaLiStDB中初步搜集的35个生活方式相关基因进行通路分析,为生活方式的联合作用及递进作用等深度机制研究提供基础。前列腺癌生活方式本体(The PCa Lifestyle Ontology,PCLiON)在 PCaLiStDB和LWAS的基础上对397种与前列腺癌发生相关的生活方式进行数据标准化,是目前少有的针对特定疾病的生活方式本体。PCLiON对329个生活方式术语进行定性分析,包括保护作用、危险作用或目前矛盾的作用等。从SNOMED CT、NCI词库、Cochrane图书馆和FooDB等资源中抽取遴选了 320个属性注释,并添加了 1 1个对象属性。PCLiON的逻辑关系和完整性均符合本体构建要求,通过双语在线平台实现了将复杂的生活方式研究数据转化为标准、可靠和响应性强的知识,既可以促进生活方式干预的共享决策制定(Shared-decision making,SDM),也可辅助患者做好生活方式自我管理。作为医学研究的数据提供者和健康知识的受用者,智慧患者可以更好地借助智能设备和知识来做好自我健康管理及参与医疗决策,促进医疗服务和自身健康管理的良性循环。通过PCLiON和PCaLiStDB在智慧患者中的应用场景设计,对前列腺癌的基于个性化生活方式的靶向预防和改善进行初步探索。本研究遵循循证医学(Evidence-based medicine,EBM)的思路和原则,系统全面地整合了前列腺癌发生相关的生活方式,并构建前列腺癌生活方式数据库-PCaLiStDB,在此基础上进行了生活方式的全关联分析-LWAS,继而构建生活方式本体-PCLiON,初步实现生活方式数据的定义和分类标准化及生活方式知识的循证转化,最后探索性地将以上研究应用于前列腺癌的智慧预防-Smart prevention。本论文的成果适用于其他疾病的生活方式研究,有利于朝着疾病生活方式精准和靶向预防的最终目标迈进。
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