蝙蝠能够携带多种病毒,病毒种类包括了疱疹病毒科(Herpesviridae),副粘病毒科(Paramyxoviridae)、弹状病毒科(Rhabdoviridae)、黄病毒科(Flavaviridae)、布尼亚病毒科(Bunyaviridae)和披膜病毒科(Togaviridae)等至少10多个病毒科。许多与蝙蝠传播有关的病毒都是新生的传染性极强的病毒。本研究分两部分:第一,关于蝙蝠携带冠状病毒与宿主进化关系的研究;第二,蝙蝠携带乙型脑炎病毒做流行病调查。第一部分研究结果证实,冠状病毒与宿主之间有很强的依赖性,二者之间的关系包括协同进化以及宿主转移两种。本研究根据冠状病毒RNA依赖的RNA聚合酶(RdRp)和蝙蝠线粒体细胞色素b(Cyt b)的基因序列数据,分析了蝙蝠冠状病毒与宿主的进化关系。系统进化分析表明菊头蝠和及其携带的冠状病毒,在种系发生上有多种关联,这提示该组研究对象在近期进化史上曾发生宿主转移。这些转移可能是由于病毒生物学特征或宿主行为特征造成的。该结果提示爆发SARS和将出现的SARS冠状病毒或相关病毒之间有联系。另一部分研究证实了蝙蝠能够作为载体携带乙型脑炎病毒。本研究通过ELISA方法检测蝙蝠血清中的乙脑抗体,并且辅助以中和抗体实验进一步验证ELISA的准确性,得出蝙蝠能够携带乙脑病毒的事实。遗憾的是,即使使用Real-Time PCR也未在蝙蝠组织中并未找到乙脑病毒序列,因此不能确定蝙蝠在乙脑病毒的流行中所起的作用。从有限的研究数据可推测蝙蝠在乙脑病毒过冬中可能起到了病毒保存的作用。本文做出以下两个假设:蝙蝠作为自然宿主,使得乙脑病毒传递到新的宿主如蚊子等;蝙蝠作为中间宿主,在乙脑的传播中起到暂时存储病毒的作用。