家蝇金属硫蛋白的cDNA克隆与序列测定

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本文在前人对家蝇MT研究的基础上,进一步探索体外扩增家蝇MT cDNA基因。试验中采用2mMCd~2对家蝇初孵幼虫诱导48小时,使其体内金属硫蛋白mRNA表达达到高峰,在液氮中将其研磨成粉末后采用异硫氰酸胍法提取总RNA,再用Promega公司提供的小量分离mRNA试剂盒纯化mRNA。以此mRNA为摸板。根据已发表的果蝇以及其它生物的MT基因的保守序列,通过计算机同源检索比较,设计两个扩增引物,命名为引物1和引物2,引物1的序列是:5’CAA GTG AAT CAT CTC AGT GC 3’,引物2的序列是:5’ TGT AGA GAG ACA AGA TGC AG 3’。再利用反转录PCR技术(One Step RNA RT-PCR Kit)直接一次性依次合成cDNA第一链、cDNA第二链、DNA扩增。用回收试剂盒回收扩增产物,再将其克隆到pMD18-T质粒载体上,在转化平板上经过氨苄青霉素抗性及α-互补初步筛选,随机挑取4个白色菌落,进一步利用转化载体pMD18-T上插入片段两端的两个限制性内切酶位点EcoRⅠ和Hind Ⅲ进行双酶切鉴定,将获得的阳性克隆子再进行PCR鉴定。最后将经过鉴定筛选的两个阳性克隆子进行序列测定与分析。结果显示:扩增的cDNA片段长度为289bp,其中含有一个编码45个氨基酸的开放阅读框,阅读框所编码的氨基酸中含有10个半胱氨酸,且在序列中均排列成Cys-X-Cys,其中X为Ser、Val、His或Lys。这些特征说明扩增的基因片段为家蝇MT基因序列的一部分。此基因序列片段与果蝇MTn基因序列的同源性达到85.0%,扩增的基因序列中含有三个内切酶位点BgⅡ、BamⅡ Ⅰ和BgⅠⅡ,这一点也和果蝇MTn基因十分相似。这说明MT基因具有保守性。推导的氨基酸序列组成分析结果显示:此MT分子量为5456.8 Da。分子中半胱氨酸含量最高,达到22.2%,其次为赖氨酸(8.0%)和丝氨酸(7.7%)。序列中还含有少量的芳香族氨基酸,如酪氨酸(3.3%),苯丙氨酸(3.0%)和组氨酸(2.8%),这一点和牡蛎MT相似,而不同于果蝇和哺乳动物MT(不含有芳香族氨基酸和组氨酸)。由扩增片段的编码序列所推导的家蝇MT与其它生物MT比较显示:家蝇MT氨基酸序列与果蝇(Drosophila melanogaster)MTn氨基酸序列的同源性最高,达到65%;与部分无脊椎动物MT氨基酸序列的同源性在35%-41%的范围内;与部分植物MT氨基酸序列的同源性比较结果为:同源性最高的为孢子植物墨角藻(Fucus vesiculosus)(51%),而最低的为种子植物鼠耳芥(Arabidopsis thalianal)(35%);与哺乳动物绿猴MT-Ⅱ的同源性达到41%,与人类MT-Ⅱ的同源性为35%。
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