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茄子(Solanum melongena L.)起源于亚洲南部热带地区,古印度为其最早的驯化地,中国栽培茄子的历史也很悠久,是茄子的第二起源地,拥有丰富的茄子种质资源。对茄子种质资源分类和遗传多样性研究,有利于茄子种质资源的收集、保存、鉴定、创新和合理利用。近年来分子标记在植物分类和遗传多样性研究中得到了广泛的应用。本试验对收集到的包括国外茄子种质和茄子近缘野生种质在内的76份茄子材料进行形态学标记以及ISSR、SSR分子标记分析,以评价供试茄子种质资源的遗传多样性水平及亲缘关系远近,主要结果如下：1.对28个形态学性状进行赋值及数据采集,结果表明：供试茄子种质的形态学性状均存在显著的遗传差异,种质间各性状平均变异系数为54.83%,其中叶刺的变异系数最大,为493.3%,果实弯曲度的变异系数最小,为10.9%；对茄子果实特征性状进行因子分析,将13个性状其划分为4个主成份；以欧式距离19.5作为聚类阈值,将76份茄子材料划分成7大类群。2.在单因素水平优化基础上,利用正交试验设计进一步优化并构建了茄子ISSR-PCR20μL反应体系,体系中包含1×buffer、2.625mM Mg2+、0.185mM dNTPs、50ng DNA模板、1UTaq DNA聚合酶,0.5μM引物。以SSR引物对该体系进行验证,得到了茄子SSR-PCR反应体系,10μL体系中各成份浓度与ISSR体系相同。3.从30条ISSR及30对SSR引物中各筛选出多态性较高的10条(对)引物,以温度梯度法确定其最适退火温度。ISSR、SSR引物在76份茄子种质中分别扩增出59和42个多态性位点,多态性百分率分别为73.8%和76.4%。4.利用NTSYsPc-2.1软件对76份种质ISSR及SSR标记的扩增结果进行统计分析,用非加权算术平均数聚类(UPGMA)法制遗传关系树状图。ISSR及SSR标记分别以DICE相似系数0.81和0.79将所有茄子材料聚为7大类群和6大类群。5.将ISSR和SSR标记统计数据合并后进行聚类分析,供试76份种质的相似性系数在0.65-0.96之间,在相似性系数水平为0.79时,将所有供试材料分为6大类群。致性检验表明：SSR分子标记的聚类结果与合并后的聚类结果更为相近。