农产品关系到国计民生，农产品供给稳定，则国家才能稳定。棉花在新疆的社会和经济中处于十分重要的地位，它作为主要的经济作物，其产业的发展关系到农民的就业以及生计，还对新疆的外汇收入有很大的影响。同时，玉米作为仅次于小麦的第二大粮食作物，在保证粮食安全方面起着举足轻重的地位。但是，近年来农资价格在飞速上涨，种植农产品的成本陡然增长，农户的收入并不乐观。农产品生产成本的大小不仅会直接影响到农民种植农产品的收益，进而影响到农民的收入，同时还会对农业产业的发展造成很大的影响。在微观层面上基于农户经营对农产品的成本和收益进行研究，了解种子、农药、化肥、农膜、人工、机耕、灌溉等这些生产要素的投入情况，通过调查分析了解哪些生产要素在农产品的成本中起到决定的作用，同时分析各生产要素在总成本中的比重、了解并能够正确计算农产品的成本，对农民收入的提高和农业产业的长足发展都有着很大的现实意义。本文的研究对象选取新疆的主要农产品棉花和玉米，使用对比分析、计量模型等方法，阐述了农产品成本项目的构成以及其形成的机理、农产品经济效益的基本理论，分析了新疆主要农产品成本变动趋势，并对新疆棉花和玉米两种主要农产品成本效益进行了比较分析。最后，针对农户视角这个微观层面进行研究，通过模型研究到底哪些影响因素对农户的选择行为在起作用。