本研究应用随机多态性DNA技术（RAPD）对江苏省·中国科学院植物研究所保存的落羽杉属种质资源（共18种材料）进行了遗传多样性分析，得到以下结论： 1．比较了两种DNA提取方法，SDS法与CTAB法提取的DNA都可用作RAPD模板，但CTAB法提取的DNA纯度较高。 2．RAPD技术在本实验条件下的最优化体系为：1×PCR缓冲液，2.5mmol·L^-1MgCl₂，0.25mmol·L^-1 dNTPs，24ng引物，20～40ng模板，1.2U TaqDNA聚合酶，反应总体积20μl。 反应程序为：于94℃中预变性4min；再在94℃中变性0.5min，36℃中复性1min，72℃中延伸1.5min，45个循环；最后一步72℃延伸7min。 3．对100条引物进行筛选，得到13个多态性好、重复性好的引物用来对供试材料进行分析。共扩增出DNA带92条，产物片段分子量变化范围为500～3000bp，其中75条具多态性，占总带数的81.5％，表明落羽杉属内具丰富的DNA序列多态性。 4．用RAPD方法对落羽杉属18种材料进行聚类分析，结果表明，原种落羽杉和池杉的亲缘关系较近，与墨西哥落羽杉的亲缘关系稍远；墨杉×柳杉杂交F₁代与母本墨西哥落羽杉聚为一类；中山杉302与母本落羽杉更为接近；在阈值为5.0时，回交一代可以聚为3类：BCF₁ 149和BCF₁ 102各为一类，BCF₁ 1、27、118、140、86、136共为一类，这与形态特征调查的结果基本一致。BCF₁ 149可以作为速生观赏类型，BCF₁ 118与BCF₁ 102可以作为速生用材类型。