基于粪便分子生物学的马鹿个体识别、亲缘关系分析及家域确定

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马鹿是国家Ⅱ级重点保护野生动物,同时也是重要的经济鹿类动物,并在我国温带森林生态系统中发挥着重要的生态作用。近年来,由于生存环境遭人为破坏越来越严重,马鹿数量急剧下降,如何研究和保护现有种群成为今后研究的重点。本论文的主要目的是运用粪便分子生态学的方法从东北马鹿的粪便中抽提出高质量的DNA,并以此为材料,通过分析东北马鹿的微卫星座位遗传多态性来获得东北马鹿的各项遗传学数据,从而对东北马鹿进行个体识别、性别鉴定、冬季家域范围、亲缘关系,以及群体间的个体交流等方面的研究,为该物种今后的研究和保护提供依据。本实验于2009年1月~3月在黑龙江省完达山东部林区收集了176个野生东北马鹿的粪便样品,使用粪便DNA提取试剂盒(QIAamp DNA Stool Mini Kit)进行DNA的提取,经检验,176个DNA样品均提取成功。从18对鹿科近缘物种的微卫星引物中筛选出4对高度多态的引物,并结合本实验室前期工作中筛选的5对引物进行PCR扩增。通过基因分型和个体识别,得出这176个粪便样品分别来自37个不同的马鹿个体。用SRY引物进行性别鉴定,结果表明这37只马鹿中有23只雌鹿,14只雄鹿,性比为1.00:0.61。通过Cervus 3.0软件进行亲权分析,得出9组父-母-子关系,并有一组存在近亲交配现象。结合野外调查的数据,本实验分析得到8个马鹿亚群,A和D群是雌雄混合群,雌性群体有B、C和E群,雄性群体有F、G和H群。本实验计算了16只马鹿个体的家域,雌性马鹿家域平均为116.98hm2,雄性马鹿家域平均为329.08hm2,雄性家域的平均面积约为雌性的两倍。群体的家域面积在22.62hm2~383.28hm2之间。群体间的个体交流频繁,单独活动的个体与群体的交流频繁,且雌性个体的迁入迁出现象多。
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