调控黄山黑鸡肌肉中多不饱和脂肪比率的关键基因鉴定及功能验证

来源 :合肥工业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lizhigang3637
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脂肪酸的含量、比例及种类对改善鸡肉品质及风味起着重要作用。明确脂肪酸在家禽体内代谢的规律和分子调控机制能够为改善鸡肉品质提供新的依据。本试验以3只具有极端高多不饱和脂肪酸比率和3只极端低多不饱和脂肪酸比率黄山黑鸡腿肌组织为试验材料,进行转录组测序分析以找出差异基因。整合差异表达基因、己报道的影响鸡肉脂肪酸代谢的数量性状基因座(Quantitative trait loci,QTL)及基因的生物学功能分析,得到10个影响肌肉中多不饱和脂肪酸含量的候选基因。其中,将脂肪酸脱氢酶2(Fatty acid desaturase 2,FADS2)基因作为后续的关键候选基因进行验证。通过构建FADS2基因的RNA干扰慢病毒表达载体,并在分离的鸡原代前脂肪细胞上鉴定其沉默效率,筛选出有效干扰序列,同时利用RNA干扰技术探讨了FADS2基因对19个脂肪酸代谢关键功能基因表达的影响及调控脂肪酸代谢机理。主要结果如下:(1)脂肪酸含量检测:通过对20个样品的脂肪酸组成进行检测,挑选出3只具有极端高多不饱和脂肪酸比率(0.324、0.329、0.324)和3只极端低多不饱和脂肪酸比率(0.285、0.261、0.265)黄山黑鸡腿肌组织为试验材料(P<0.01)。(2)转录组测序筛选关键基因:通过转录组测序,本研究发现了274个差异表达的基因。GO和KEGG分析表明,差异表达基因富集的生物过程主要参与不饱和脂肪酸的合成、脂肪酸代谢和细胞连接等相关的途径。综合分析差异表达基因与以往报道的QTL表明FADS2,DCN,FRZB,OGN,PRKAG3,LHFP,CHCHD10,CYTL1,FBLN5和ADGRD1是影响黄山黑鸡肌肉中多不饱和脂肪酸比率的关键基因。(3)关键基因的功能验证:试验以鸡FADS2基因m RNA序列作为干扰靶点,设计3组靶向FADS2的小干扰RNA(si RNA)。FADS2-si RNA慢病毒重组质粒侵染鸡前脂肪细胞筛选出FADS2-si RNA F1组沉默效果达60%。构建FADS2基因稳定下调的鸡前脂肪细胞模型。FADS2基因被沉默后,ELOVL5,FADS1,ACACA,ACSL1,LPL,PPARG,LPIN1,ADFP,XDH,PLIN2,ACOX1等脂肪酸代谢相关基因的上调量分别为14.91%,24.59%,54.56%,29.59%,39.57%,11.55%,45.94%,67.56%,195.49%,67.55%,31.62%;ELOVL6,ACLY,CD36,ACSS2,SREBF1,INSIG1,GPAM,PNPLA2等脂肪酸代谢相关基因的下调量分别为12.63%,27.33%,14.19%,23.42%,19.22%,16.59%,14.88%,34.14%。确定FADS2基因为影响黄山黑鸡肌内多不饱和脂肪酸含量的关键基因,为后期明确脂肪酸的调控通路提供了理论依据。
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