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真姬菇(Hypsizygus marmoreus)是一种实现了工厂化生产的珍稀食用菌。目前市场上销售的真姬菇,子实体颜色可分为灰褐色和白色两大类。白色真姬菇较之灰褐色价格更高,但白色真姬菇菌株有限,且产量较低、栽培周期较长、抗性较弱,因此,开展白色菌株种质研究,丰富白色菌株种质资源,进行材料准备和实验探索,具有理论和实际意义。本文对两种颜色真姬菇菌株孢子单核体杂交和栽培实验,初步确定了两种颜色之间的显隐关系；进一步应用RAPD、SSR技术分析了原生质体单核体、孢子单核体遗传多态性,并发掘出白色菌株的特异性标记。1.通过栽培实验,观察27个真姬菇菌株子实体颜色,除了SIEF3136菌株为纯白色外,其他菌株的菌盖颜色为灰褐色到深灰褐色之间。进一步选择灰褐色菌株SIEF3133和白色菌株SIEF3136为材料,分离获得SIEF3133菌株孢子单核体67个,SIEF3136菌株孢子单核体82个。选择部分单核菌株配对杂交,16组合有12组亲和,共获得48株杂交菌株,两批出菇颜色统计显示,所有杂交菌株的颜色——原基为灰色、子实体菌盖为灰褐色,而与SIEF3136子实体颜色为纯白色差别很大。真姬菇菌株菌盖灰褐色相对白色为显性。2.两个原生质体单核体对RAPD引物筛选,得到可扩增清晰条带的引物72个,其中30个不同交配型的SIEF3136单核体扩增,筛选得到具有多态性的引物38个,多态率为74.2%,单核间的相似系数在0.34-0.90之间。相同交配型间都在0.60以上,相对较高；而两个原生质体单核体间为0.41,遗传差异较大；T1(A3B3)、T3(A3B4)聚在第一大类,T2(A4B4)、T4(A4B3)聚在第二大类。另外,54对SSR引物对SIEF3136单核体扩增,21对可以扩增出多态性条带,多态率为54.86%,说明SSR标记可以作为真姬菇单核研究手段。3.利用筛选得到的RAPD引物,对27株真姬菇扩增,获得3个SIEF3136菌株的特异性引物。其中引物S2116扩增中特异性条带TS2116可以在杂合体及SIEF3133单核体中稳定传递,而在SIEF3136所有供试单核体(孢子单核体、原生质体单核体)中都未出现,因此,该标记可作为白色SIEF3136菌株与灰褐色菌株区分的特异性标记,推测该标记可能与灰褐色菌盖颜色基因相关联。