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本研究采用MSAP技术检测莆田黑猪不同生长发育阶段不同组织基因组甲基化模式,并应用BSP技术分析莆田黑猪、杜洛克猪及其与莆田黑猪杂种杜莆猪的不同组织H-FABP基因启动子甲基化状态,旨在为地方猪选育和猪脂肪沉积的分子育种研究提供科学理论依据。1、采用MSAP技术,选择16对引物组合对莆田黑猪不同生长发育阶段基因组甲基化模式检测,主要结果如下:(1)1日龄甲基化水平,一共扩增条带12324个,其中半甲基化条带2510个,全甲基化条带3557个,非甲基化条带6257个。半甲基化水平中,肝脏的半甲基化水平分别显著高于心脏、肌肉、尾(P<0.05)。全甲基化水平中,心脏的全甲基化水平显著高于肝脏、肌肉、脂肪、耳和尾(P<0.05)。总甲基水平化中,心脏的总甲基化水平显著高于肝脏、肌肉、脂肪、耳和尾(P<0.05);尾的总甲基化水平分别显著高于肌肉、脂肪和耳(P<0.05),分别显著低于心脏和肝脏(P<0.05)。(2)25日龄甲基化水平,一共扩增条带11505个,其中半甲基化条带1997个,全甲基化条带3740个,非甲基化条带5768个。半甲基化水平中,心脏的半甲基化水平显著高于肌肉(P<0.05);肝脏的半甲基化水平显著低于脂肪(P<0.05);肌肉的半甲基化水平分别显著低于心脏、脂肪和耳(P<0.05)。全甲基化水平中,心脏、肝脏、肌肉、脂肪、耳和尾之间无显著差异性。总甲基化水平中,心脏的总甲基化水平显著高于肌肉(P<0.05),显著低于脂肪和耳(P<0.05):肌肉的总甲基化水平分别显著低于心脏、脂肪、耳和尾(P<0.05)。(3)210日龄甲基化水平,一共扩增条带11850个,其中半甲基化条带2294个,全甲基化条带2867个,非甲基化条带6689个。半甲基化水平中,心脏的半甲基化水平显著低于脂肪、耳和尾(P<0.05);肝脏的半甲基化水平显著低于脂肪、耳和尾(P<0.05):肌肉的半甲基化水平显著低于脂肪和耳(P<0.05)。全甲基化水平中,心脏、肝脏、肌肉、脂肪、耳和尾之间无显著差异性。总甲基化水平中,心脏的总甲基化水平显著低于尾(P<0.05);肝脏的总甲基化水平显著低于脂肪、耳和尾(P<0.05);肌肉的总甲基化水平显著低于脂肪和尾。2、莆田黑猪不同生长发育阶段心脏、肝脏、肌肉、脂肪、耳和尾的全甲基化水平都高于半甲基化水平。3、莆田黑猪1日龄、25日龄和210日龄阶段平均总甲基化水平分别为50.67%、49.89%、43.55%,其随着年龄增长而降低。4、莆田黑猪相同生长发育阶段不同性别间半甲基化、全甲基化和总甲基化水平无明显的差异性,相同性别内半甲基化水平都要低于全甲基化,不同生长发育阶段公猪的总甲基化水平都略高于母猪。5、通过BSP法分析得出,莆田黑猪、杜洛克猪和杜莆猪心脏、肌肉和耳的H-FABP基因启动子甲基化在210日龄阶段均展现出较低甲基化水平。6、不同猪种中,心脏、肌肉和耳的H-FABP基因启动子甲基化水平均无显著差异性,相同组织在不同猪种中H-FABP基因启动子甲基化水平差异也不显著。7、莆田黑猪、杜洛克猪和杜莆猪心脏、肌肉和耳H-FABP基因启动子区的CpG位点甲基化状态分析得出,每种组织都检测出35个CpG位点,3种猪3种组织均有3个高度甲基化水平的CpG位点,且它们有相同的序列位置。