面对科学技术高速发展，全球信息网络化和世界经济一体化的激烈竞争环境，供应链管理一直是近年来理论界和企业界所共同关注的重要研究课题之一。其中，供应链成员之间的合作关系是供应链战略成功的一个关键因素，而供应链的复杂性所导致的供应链的不确定性问题在相当程度上对合作关系构成影响。因此，对供应链不确定性对合作关系的影响进行研究具有非常重要的理论与实际意义。论文阐述了供应链管理的基本概念和理论，在系统总结前人工作的基础上，采用了定量和定性分析相相结合的方法，通过对调查问卷所收集到的大量数据进行SPSS统计分析，对供应链不确定性对合作关系的影响进行了较深入地研究探讨。本研究把供应链的不确定性从结构因素、诚信因素、信息因素、个体因素和环境因素5个维度展开分析，把供应链合作关系用“供应链竞争力的提升”、“创新能力与柔性的提高”、“伙伴参与的积极性”、“合作伙伴的和谐度”和“合作伙伴的满意度”五个指标来评价，建立了研究的理论模型，并得到了以下重要研究结论：供应链不确定性的5个因素对于供应链合作关系各个评价指标的影响程度各不相同，其中结构因素显得尤为重要。核心企业的企业性质对供应链不确定性和供应链合作关系都有着显著的影响，中外合资企业和国有企业的供应链不确定性明显低于民营企业。中外合资企业的供应链合作关系明显优于民营企业。核心企业的企业规模对于供应链不确定性和供应链合作关系都有着显著的影响，企业规模越大，不确定性越小，合作关系越良好，其中营业额在3000万元和营业额在50亿元是具有显著的差异的两个分水岭。本文的研究成果，对供应链管理的深入研究和实践具有一定的参考和借鉴价值。