本研究借助RAPDs标记和微卫星标记对29份中国芥菜材料的遗传多样性以及亲缘关系进行了分析和评价。实验结果表明,本次实验所采用的两种分子标记对29个芥菜类材料险测出了不同的多态性水平。RAPDs标记检测出平均73.83%的多态性,微卫星标记检测出了平均82.1%的多态性。本实验所采用的11对微卫星引物总共扩增出了101条多态性谱带,平均每对引物扩增出7.21条多态性谱带。本实验所采用的RAPDs标记,总共22条随机引物扩增出了124条多态性谱带,平均每条引物扩增出了5.64条多态性谱带。以谱带的有无为原则,建立了Jaccard遗传距离矩阵,并且在建立距离矩阵的基础上,以STATISTICA统计软件建立了33份材料遗传多样性和亲缘关系的系统树图。通过SAS software检验检测了两种分子标记分析结果的相关性,相关系数达到0.8869。另外,在两种分子标记基础数据合并的基础上,建立了一个联合数据距离矩阵并重新以STATISTICA统计软件建立了33份材料遗传多样性和亲缘关系的系统树图。分析结果表明,联合的系统树图表现的材料间的亲缘关系在一定程度上比单个的分子标记更合理。RAPDs标记分析的结果表明,如根芥菜里的本人头菜和杨庙大头菜被聚类于一个小组内:还有茎芥菜里的特大棒菜和芥笋;薹用芥菜里的黑叶菾菜和枇杷叶辣菜;茎瘤芥菜里的浙桐3、4号和温州的圆叶榨菜;叶芥菜里的大叶黄种雪里蕻、金丝芥菜和花叶芥菜:具有卷心或结球特性的结球芥菜、包心芥菜和大肉包心芥菜;以及芽芥菜里的花叶儿菜与妹儿菜。33份材料之间的平均遗传距离为0.523,遗传距离最小值为19号材料包心芥与26号材料大肉包心芥之间的0.098,最大值为3号材料杨庙大头菜与31号材料温州盘菜之间的0.834。 微卫星标记聚类分析把中国芥菜分成了两个大组,3个根用芥菜材料被划分到了一个小组内,同样,3个芽芥菜类型同处于一个小组内,还有结球芥、包心芥;金丝芥与花叶芥;薹用芥菜里的梅菜与枇杷叶辣菜;茎用芥菜里的圆叶榨菜与浙桐3号等都构成了符合形态学分类的分组,作为中国芥菜的一个原始亲本种的大白菜与小白菜处于较远的亲缘关系,而与温州盘菜处于一个小组内。中国芥菜内部的遗传距离的平均值为0.638,参加实验的材料个体间最大遗传距离是4号材料特大棒菜与31号材料温州盘菜之间的0.859,最小是16号材料结球芥与19号材料包心芥之间的0.099。 两种分子标记的聚类图中都有部分材料的划分与形态学划分不相符,特别是叶用芥菜内部,籽用芥菜作为一个典型的材料,在两种分子标记方法中处于不同的分类地位。 本实验表明,不同的分子标记对相同的作物群体揭示出的遗传多样性水平和变异水平