证券结算系统是证券市场运行的后台，结算系统是否能高效、安全运行直接影响到证券市场的发展，影响到整个金融系统的健康运作。充分利用后发优势，我国证券结算获得了快速发展，证券结算的硬件设施甚至已处于世界领先地位，然而与之相对应的证券结算制度建设却相对滞后。本文仅选取其中最重要的3个问题进行研究，以期能为我国证券结算制度的完善提供帮助。本文总共分为5个部分：第一部分为证券登记结算制度简介，旨在为本文提供一个背景性知识，通过对证券登记、托管、存管以及证券结算法律关系等内容的介绍，为本文开展论述提供基础。第二部分为证券持有模式，分析了证券直接持有和间接持有模式的特点以及不同国家证券持有模式的制度建设，以期为我国建立“以直接持有为主，间接持有为辅”的结算模式提供参考建议。此外，通过对比分析美国、德国、英国证券投资者财产权保护的不同立法模式，以期为完善我国证券投资者权利保护提供参考。第三部分为中央对手方制度，分析中央对手方对提高证券结算效率以及保障交易安全的重要作用，并通过借鉴美国、欧盟、香港的中央对手方制度建设的经验，以期能为我国建成一个高效、安全的中央结算机构提供帮助。第四部分为证券结算及其风险，分析我国证券市场面临的风险及其原因，介绍发达证券市场在风险控制制度建设取得的成就，以期能我国证券结算风险控制制度的完善提供有益的经验。第五部分为完善我国证券结算制度，主要包括完善证券结算参与人制度、中央对手方制度、DVP制度以及其他风险控制制度。其中通过健全证券结算参与人市场准入制度和证券结算参与人持续监管制度来完善我国证券结算参与人制度。通过加强立法以及完善中登公司内部控制制度和外部监管来健全中央对手方制度。通过比较DVP的三种模式的优缺点，并结合我国证券市场发展状况，主张在我国采取DVP3模式。