目的：研究在体外循环心脏不停跳手术与体外循环心脏停跳手术中，Caspase-3激活与表达的差异性以及对心肌凋亡程度的影响，为临床工作提供新的思路。方法：清洁健康新西兰大白兔，随机分为2组(n=12)，分别为实验组（心脏不停跳组）和对照组（心脏停跳组）。对照组麻醉后常规插管转机，降温至28-30℃时阻断升主动脉,灌入15-20ml/kg4℃St.ThomasⅡ停跳液。并与15min及40min各半量灌注一次。第三次灌注后开始复温，34℃时恢复灌注，使心脏复跳并行循环，待生命体征平稳后，停止体外循环。实验组组常规插管，不阻断主动脉，不降温，转机120分钟后缓慢停止体外循环。实验动物转机后2小时仍存活视为实验成功。迅速取出心脏采集心肌标本，应用荧光定量PCR测量兔心肌线粒体Caspase-3mRNA表达水平，TUNEL法观察心肌细胞凋亡情况。结果：（1）心肌细胞凋亡指数：实验组（4.24±1.39）较对照组（11.26±2.28）低（2）实验组Caspase-3的mRNA相对表达量（0.434±0.024）较对照组（1.058±0.081）低。结论：（1）体外循环心脏停跳组Caspase-3的mRNA较心脏不停跳组高表达，说明Caspase-3参与了心肌细胞凋亡，同时心脏不停跳手术能够一定程度上保护心肌。（2）体外循环心脏停跳组与体外循环心脏不停跳组均有细胞凋亡的发生，体外循环心脏停跳组的凋亡率明显高于不停跳组。