随着经济发展进入新阶段，技术创新的作用也越来越凸显，技术创新对金融结构是否有所选择，银行与市场主导型金融结构哪个更能促进科技创新的发展成为重要问题。中国技术创新水平近年显著提升，经济发展进入转型关键期，因此需要选择合适的金融结构支持技术创新的发展，但中国金融市场发展历程较短，为对比两金融结构的不同需借鉴发达国家发展经验，本文选择两代表性国家——美国、德国进行分析。　　本文选择两种金融结构的典型代表国家德国和美国进行分析，定性定量的分析了金融结构与科技创新的关系影响。在总结国内外已有文献的基础上，选取两国1981-2015年的时间序列数据进行定量分析，在VAR模型和VEC模型的基础上采用脉冲响应函数和方差分解进行研究，根据实证分析结论并结合美德两国的经济环境差异总结出发展经验。　　本文研究主要得出以下结论:(1)相较于银行主导型金融结构，市场主导型金融结构更有利于促进技术创新，直接融资比例尤其是股权融资比例的提高更有利于技术创新型企业的融资;(2)市场主导型金融结构中，金融市场规模的扩大和流动性的提高也有利于技术创新，因此在提高直接融资比重的时候仍需注意完善资本市场，逐步扩大资本市场规模，完善资本市场的信息传导机制;(3)金融市场较发达时，科技创新对金融结构基本没有影响，金融市场不够发达时，科技创新的发展会长期促进股票市场的发展;(4)从外部环境来看，持续稳定的经济增长有利于技术创新，国家政策对技术创新的影响具有长期性和持续性，整体外部环境质量尤其是法律环境的改善对技术创新的影响要优于单独的税收优惠等政策。　　本文结合中国实际情况并与美国、德国相对比，发现中国技术创新主要集中于新兴产业，与美国相似;金融结构中银行信贷占比较高，股权融资占比较低，近年出现股权融资增长的态势;技术创新实力较强，专利申请量居于全球首位，金融结构改革较为迫切。据此给出几条具体建议:发展多层次资本市场，大力提高直接融资比重;两条腿走路，提高间接融资效率;加强科技政策扶持力度，促进创新长期发展;完善法律制度环境，营造良好外部环境。