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肠道病毒71型(Enterovirus-71，EV-71)属于小核糖核酸病毒科。EV-71是手足口病(Hand，footandmouthdisease，HFMD)的主要病因，也能导致干细胞脑炎和其他中枢神经系统并发症(centralnervoussystemcomplications，CNS)，最终可能在儿童中引起致命的结果。目前还没有能有效预防和治疗EV-71感染的疫苗或抗病毒药物。EV-71的基因组只有一个大的开放阅读框，编码一个多聚蛋白前体。对这个多聚蛋白前体进行切割产生的功能性蛋白对病毒的复制有重要作用。这些切割是由两个病毒蛋白酶介导的，这两个酶分别叫做2A蛋白酶(2Apro)和3C蛋白酶(3Cpr)。2Apro能够从非结构蛋白中切出结构性蛋白，另外，此蛋白酶也能切割真核翻译起始因子4G(eukaryotictranslationinitiationfactor4G，eIF4G)及其他宿主因子。因为具有单一的结构和功能特征，所以2Apro被认为是抵抗EV-71病毒的一个优良靶点。因此，解析这个蛋白酶的结构具有重要意义。本文中，我们在1.70(A)的分辨率下解出了一颗EV-71病毒2Apro晶体的三维结构。我们首先将2Apro构建到pGEX-4T-1载体中并在E.coli中得到了高产量表达的带GST标签的融合蛋白。使用亲和层析技术纯化融合蛋白后，利用凝血酶thrombin切除GST标签，进一步使用凝胶过滤层析技术纯化得到了重组蛋白。在筛选了大约1000多个结晶条件并对有效条件进行了进一步优化后，获得了用来衍射的蛋白晶体。使用Mar345桌面光束X射线衍射系统和RigakuX射线发生器对晶体进行衍射并收集数据。利用分子置换法解析出EV-71病毒2Apro的结构。这个高分辨率的EV-71型2Apro的结构给基于结构学的抗EV-71病毒导致的致死性疾病的治疗技术的开发提供了坚实的基础。