Y交叉口是城市道路的通行瓶颈,多见于上游匝道、下游匝道、车道减少路段。交替通行作为解决Y交叉口交通拥堵的有效方式,已经部分地应用于中国的一些城市中。但在现实中,由于缺乏有效的监督机制与处罚力度不够等原因,这一规定常常为驾驶员忽视。从而严重制约城市道路系统通行效率。在拥堵环境下,驾驶员所面临的困境是采取何种合并行为（强制合并或合作合并）,本研究在补充已有研究空白的基础上,基于驾驶员信用提出了可以优化Y交叉口通行次序,提高车辆通行效率的解决方案。本研究辨识与抽象出驾驶员行为决策的关键因素,从而提出Y交叉口的三阶段驾驶决策模型。引入用于表征驾驶员信用的智慧出行积分（Intelligent Travel Points,ITPs）,提出基于合作理论的“交替合并”概念,并运用博弈论原理创新性地提出驾驶次序博弈（DOG,Drive order game）,研究交替通行的博弈演化过程。采用计算实验方法（Agent-based Model,ABM）建立了包含物理层面、信用层面、交互层面的Y交叉口通行模型,在分析Y交叉口的驾驶员行为特征的基础上,进一步揭示交替通行的形成机理。根据模型运行结果,构建了Y交叉口通行评价体系,包括合作效率、系统平均合作率、路段通行的均匀化程度。最后,采用多因素方差分析（MANOVA）的方法,分别分析了ITPs中的偏好值a以及驾驶次序推荐系统（Driving order recommendation system,简称DORS）设定的5个最大允许让行车辆数h以及两者的交互作用对合作效率、系统平均合作率、路段通行均匀化程度的影响。在推荐出的最佳参数的基础上提出了相关的政策建议。在交替通行状态下,驾驶员之间的合作率达到了较高水平,Y交叉口的通行效率大大提高。本研究引入驾驶员信用评价体系后,驾驶员的合作自觉性明显增强,在一定的条件下（如h=1,a=0.5时）,交替通行状态可以使得合流区的通行效率提高13.79%。因此,本研究致力于从信用管理的角度进一步推动Y交叉口甚至整个道路系统的拥堵治理。给出了建立完善驾驶员信用评估体系、推动交通拥堵多元主体共治以及合理建设出行信息化平台三个方面的政策建议。