目的：探讨新疆地区维吾尔族和汉族妇女乳腺癌患者中环氧合酶-2(COX-2)基因在mRNA水平表达差异。方法：收集2012至2014年新疆医科大学附属肿瘤医院均经外科手术治疗的、详尽的乳腺癌病例资料及符合实验要求的新鲜标本组织,应用实时荧光定量聚合酶-链式反应(QRT-PCR)技术检测乳腺癌组织、癌旁组织及纤维腺瘤组织中mRNA表达水平,分析COX-2基因在乳腺癌中表达及维、汉组间乳腺癌患者及两组组内的基因表达水平。结果：41例汉族癌、8例癌旁及16例良性组织中COX-2表达水平分别为1.71(0.71-6.83)、1.25(0.76-1.39)、0.42(0.15-0.93)；与良性对照组相比,COX-2在癌组织中表达明显升高,差异有统计学意义(P<0.01)；38例维吾尔族癌、13例癌旁、11例良性纤维腺瘤组织中COX-2基因表达水平分别为0.16(0.05-0.96)、0.39(0.18-0.88)、1.62(0.34-10.21),与对照组相比,同时可见COX-2基因在维吾尔族妇女癌组织中表达明显升高,差异有统计学意义(P<0.05)；且维、汉两组癌组织比较差异有统计学意义(P<0.01)。维吾尔族、汉族两组纤维腺瘤良性组织比较,COX-2基因表达水平分别为1.00(0.29-3.75)、0.42(0.15-0.93),差异无统计学意义(P>0.05),COX-2的表达与肿瘤大小比较有统计学差异(P<0.05)；结论：乳腺癌患者中COX-2基因表达较良性组织明显增高；维、汉两组间良性组间比较差异无统计学意义；维吾尔族和汉族患者COX-2基因表达差异有统计学意义,提示COX-2表达有种族差异性。