目的分析安徽省2008～2012年手足口病的流行病学和病原学特征，明确手足口病防控的重点地区和重点人群，为安徽省手足口病的防控提供科学的决策依据。方法利用“中国疾病预防控制信息系统”，采用描述流行病学方法对安徽省2008~2012年手足口病监测资料和部分患者病原学监测结果进行统计分析，采用荧光定量PCR方法对部分手足口病病例进行肠道病毒核酸检测。结果安徽省2008~2012年累计报告手足口病360873例，年平均发病率为119.53/10万，重症病例1878例，重症率0.52%，死亡病例79例，病死率21.89/10万。发病水平呈逐年上升的趋势，发病高峰集中在4-7月；安徽省淮河以北地区发病率高于长江以南地区，长江以南地区发病率高于江淮之间，不同区域之间发病率之间有统计学意义；男性发病高于女性，男女发病率之间有统计学意义，以5岁以下的散居儿童为主；不同的年龄段，重症率存在差异；病原学监测结果肠道病毒71型(EV71)所占比例为55.5%，柯萨奇病毒A16型(Cox A16)所占比例为26.6%。结论安徽省手足口病流行有明显的季节性、地区性和人群性，呈点多面广、高度散发的流行特征。安徽省人口密度高的北方农村地区，3岁以下散居儿童是我们防控的重点人群。引起手足口病普通病例流行的病原体主要为EV71和CoxA16，不同年份间流行优势株有所差别，2012年EV71和Cox A16所占比例出现明显下降，重症病例和死亡病例的流行优势毒株均为EV71。安徽省流行的EV71毒株VP1基因分型均为C4a亚型，与国内其他省份流行的EV71保持着高度的同源性。