在“大众创业、万众创新”战略不断推进的过程中,创业观念不断深入人心,创业活动的开展不断深入。而创业活动的有效开展需要一个多要素多层面联动的创业生态系统提供动力支持。近几年,国家关于创业主题的政策也多次强调:推进创业生态系统建设和优化。在此背景下,本文借鉴创业理论和相关生态学理论对山东省区域创业生态系统运行效率进行测算,对于完善山东省创业生态系统有着重要的意义。首先,本文在梳理相关文献的基础上,依据相关理论构建了创业生态系统运行的理论模型。进而,依据理论模型构建了创业生态系统运行效率测算的指标体系,并以山东省各地级市为例,使用三阶段DEA模型进行了测算和比较分析,结果显示:山东省创业生态系统运行效率值偏低,并且各地级市创业生态系统运行效率值差距较大,且规模效率是影响综合技术效率的主要原因;山东省17地市依据创业生态效率的纯技术效率和规模效率高低可分为“双高型”“高低型”“低高型”和“双低型”4类区域,其中“双高型”区域包括济南市、青岛市、东营市、潍坊市、德州市、聊城市和菏泽市,“高低型”区域包括烟台市和莱芜市,“低高型”区域包扩淄博市和滨州市;“双低型”区域包括威海市、济宁市、枣庄市、临沂市、泰安市和日照市。然后,使用剔除了环境因素和随机干扰之后的效率值作为被解释变量,选用区域经济环境、对外开放程度、用政策支持力度、产业结构、基础设施水平这5个因素作为解释变量,构建Tobit模型,对山东省创业生态系统运行效率具体的影响因素进行分析,结果发现:区域经济环境、对外开放程度、政策支持力度对山东省创业生态系统的运行效率具有显著正向影响;产业结构对山东省创业生态系统的运行效率无显著影响;基础设施水平对山东省创业生态系统的运行效率具有显著负向影响。最后,根据实证分析结果,本文提出了促进区域创新效率提升的政策建议:强化政府引导示范作用;实施创业生态系统区域化合作战略,提高规模效率;实施差异化政策,实现资源优势互补;因地制宜,因势制宜;发挥具有正向影响的因素,消除具有负向影响的因素,通过针对性建议促进山东省创业生态系统的发展,提升运行效率。