我国专利民事侵权程序与行政无效程序的双轨制面对日益剧增的专利民事侵权案件,其影响诉讼效率和个案公正的缺点被逐渐放大,相关工作人员对修正这种“双轨制”呼声越来越大,也因此改革显得有必要性和合理性。其实自我国在专利民事侵权程序采用“双轨制”后,就出台过一些相关的司法解释与规定来应对上述所说的弊病,但并未从根本上解决该体制的弊端,甚至于矫枉过正的做法导致了法院对于专利民事侵权诉讼中某些相似案例下的裁判结果产生分歧或违背了专利法的立法目的。本文分析了我国现行“双轨制”构造存在的一些问题以及司法实践中为解决这些问题所做出的探索,结合法院迂回地进行专利权效力审理的若干代表案例,借鉴发达国家的相关做法,对在我国专利侵权诉讼中引入专利无效抗辩理由的顾虑进行解析,论证在专利侵权诉讼中引入无效抗辩理由的可行性,并对诉讼中无效抗辩理由的范围进行厘定,尝试提出相应立法建议。