蓝狐(Alopex lagopus)微卫星位点的筛选及遗传特征的初步评价

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蓝狐(Alopex lagopus)、银狐(Vulpes logpus)是我国重要的毛皮经济动物,其饲养历史悠久,但我国蓝银狐饲养存在谱系管理不清、近亲繁殖、遗传管理不合理等许多问题。而微卫星DNA在研究遗传多样性分析、基因组作图、QTL定位、疾病诊断与病理研究、亲缘关系鉴定及个体识别等方面发挥着巨大的作用,因此将微卫星引入到蓝银狐的饲养当中可以很好的解决以上问题。然而目前国内外对狐类动物的微卫星分离的研究很少。本文以蓝狐基因组DNA样品为材料,经Sau3 AⅠ酶切并电泳后回收300bp~900bpDNA片段,经过与生物素标记的(CA)15探针杂交,再用MagneSphere? MagneticSeparation Products磁珠(购自Promega公司)富集和PCR扩增后,构建了微卫星富集文库。利用PMD-18载体上的序列设计一条引物分别与(CA)10N、(TG)10N进行PCR反应来检测阳性克隆,并将阳性克隆送去测序。共得到55个含有微卫星的序列。筛选并选择了6个多态性较好微卫星序列,利用丙烯酰胺凝胶分析了饲养条件下蓝狐、银狐对各个位点等位基因数目、等位基因片段大小范围、等位基因频率分布、观察杂合度等指标,结果显示:6对微卫星引物的在30个蓝狐样本中平均有效等位基因数(Ne),介于1.3245~5.7515,平均值为3.2594;期望杂合度介于0.245~0.8261之间,平均值为0.507;观望杂合度介于0.1613~0.8125之间,平均值为0.4751;多态信息含量介于0.24~0.8001之间,平均多态性信息含量为0.5115。6个微卫星位点在30个银狐样本中平均有效等位基因数(Ne)介于1~5.3248之间,平均值为2.9578;期望杂合度介于0~0.8122之间,平均值为0.5487;观望杂合度介于0~0.6之间,平均值为0.3404;多态信息含量介于0~0.7455之间,平均多态性信息含量为0.4161。通过上述诸方面的分析研究,得到以下结论:通过筛选得到的这6个微卫星位点可以作为分析蓝狐、银狐遗传多样性的研究;蓝狐的遗传多样性较好,银狐需要对种源进行改良。
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