论文部分内容阅读
目的在中国北方人群中识别阿尔茨海默病(AD)的易感基因,并验证其与AD的关联性。方法1.研究人群选择北京AD患者248例,同地区年龄、性别匹配408例对照。通过文献检索和生物信息学分析,筛选出GBP2、BIN1、ADAM12、FRMD4A、SORL1、PICALM、MS4A4E、TOMM40基因及3号染色体和4号染色体区间,共10个未在中国人群中进行与AD关联性报道的候选SNPs位点。通过PCR-HRM(聚合酶链反应-高分辨率率溶解曲线)技术并结合随机抽样方法测序验证分型结果的准确性,对研究人群进行10个位点的基因分型检测。2.使用SPSS统计软件及GMDR等软件分析各位点等位基因、基因型及遗传模型频率在两组的分布,验证候选位点与中国北方人群AD风险的关联,并且分析各位点基因、基因型及遗传模型与AD临床表型的关联。探索候选位点在AD患者中携带ApoE风险基因型与非携带组间的基因型频率差异。结果1.在中国北方人群中,筛选的10个位点有3个与AD关联,分别是rs7081208、rs3851179、rs10119(P=0.045,P=0.032,P=0.01)。2.遗传模型分析中发现:rs1425967单核苷酸多态性的基因型AG与AD有关联(P=0.002,OR=0.61);rs11244841单核苷酸多态性的基因型CT、TT、CT+TT与AD存在风险关联(P=0.032,OR=4.59;P=0.026,OR=4.68;P=0.026,OR=4.66);rs3851179单核苷酸多态性的基因型CT、CT+TT与AD风险关联(P=0.01,OR=1.58;P=0.021,OR=1.49);rs10119单核苷酸多态性的基因型CT、CT+TT与AD患病风险有显著性关联(P=0.004,OR=1.684;P=0.013,OR=1.158)3.在ApoE风险基因型协同作用分析发现:rs11244841单核苷酸多态性的基因型CT+TT在携带ApoE基因rs429358单核苷酸多态性风险基因CT+TT组中多于非携带组(P=0.003,OR=11.73)。4.在AD患者临床变量痴呆程度分析中发现:rs2221154单核苷酸多态性T等位基因与痴呆程度有显著性关联(P=0.003);rs1425967单核苷酸多态性的共显模型中基因型AG与GG与痴呆程度相关(P=4.39×10-4,P=0.002);rs7081208单核苷酸多态性的等位基因G及基因型GG与痴呆程度有显著性关联(P=0.01,P=0.01);rs720099等位基因C及显性模型中基因型CC+CT与痴呆程度也有显著性关(P=2.24×10-16,P=0.038)。5.基因交互作用分析提示:单核苷酸多态性rs10119CC或CT-rs3851179CC或C基因间的互作关系明显,病例组患AD的风险显著高于对照组。6.危险基因型累积效应分析发现:单核苷酸多态性rs7081208、rs3851179与rs10119随着危险基因型数目的增多,病例组和对照组间含有的危险基因型数目的越多,个体患AD的风险越大(OR值由1.79增大2.09再到4.94)。结论1. FRMD4A基因rs7081208、PICALM基因rs3851179与TOMM40基因rs10119可能是中国北方人群的AD易感基因。2.rs1425967单核苷酸多态性的基因型AG、 rs11244841单核苷酸多态性的基因型CT、TT、CT+TT可能会增加AD的患病风险。3. ApoE基因rs429358单核苷酸多态性风险基因CT+TT会增加rs11244841单核苷酸多态性的基因型CT+TT对AD的作用。4. rs2221154等位基因T、rs1425967基因型AG与GG、rs7081208等位基因G及基因型GG、rs720099等位基因C及显性模型中基因型CC+CT与痴呆程度相关。5. rs10119CC或CT-rs3851179CC或CT基因之间的交互作用会增加患AD的风险。6. rs7081208、rs3851179与rs10119单核苷酸多态性的危险基因型数目叠加会增加个体患AD的风险。