萝卜种质资源遗传多样性的SSR分析和初级核心种质构建

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萝卜(Raphanus sativus L.)是我国的一种重要的蔬菜,我国萝卜种质资源十分丰富。随着社会经济和现代农业的发展与新品种的选育,栽培品种的遗传背景日益狭窄,萝卜遗传资源多样性遭到破坏或丧失。因此科学家开始重视萝卜种质资源的收集和保存工作,而开展萝卜种质资源遗传多样性的研究,有利于现有萝卜种质资源的高效利用。 分子标记能直接从DNA水平反映各材料间的遗传差异,是研究生物遗传多样性的有力工具。SSR标记具有简单、快速的优点,被广泛地用于遗传多样性和种质分类研究。本试验采用SSR标记,结合系统聚类分析和主坐标分析,对47份萝卜种质资源的遗传多样性进行了研究,为了提高现有萝卜种质资源的利用效率,开展了构建萝卜核心种质的初步研究。 主要试验结果如下: (1)从20对引物中筛选出6对引物,对47份萝卜种质进行了SSR分析,共扩增出24条带,其中多态性带为16条,多态性百分率为63.89%,平均期望杂合度为0.8750。种质间的相似系数范围为0.33333-0.958333,系统聚类分析将47份种质分为4个大组,主坐标分析将其分为4个大组,两种分类方法结果基本上一致。 (2)利用441分萝卜种质,在不同抽样比例下,构建核心种质,比较了马氏距离和欧式距离在核心种质中的优劣,认为马氏距离更适合于构建萝卜核心种质;本研究采用最短距离法、最长距离法、可变类平均法和离差平方和法聚类,结果表明4种方法构建的核心种质都能极显著地增加性状的方差和变异系数。四种聚类方法中,以最小距离法为最好,经过分析确认在构建中小规模萝卜核心种质时15%的比例是合适的。 (3)本研究以1281份为试材,基于表型形状构建了萝卜初级核心种质,由于各抽样比例的核心种质都能代表原群体的遗传多样性,确定了15%的最佳比例,构建了192份材料组成的初级核心种质。构建的萝卜初级核心种质级代表了原有群体的遗传变异,又有广泛的地域代表性
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