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结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis, Mtb,简称结核杆菌)是结核病的主要致病菌。艾滋病合并结核病和耐多药结核病使得结核病的诊断和治疗成为全球面临的重大挑战。寻找结核杆菌新标识分子用于结核病诊断或疫苗候选抗原具有重要意义,分子标识的研究方法包括基因水平和蛋白质水平,蛋白质组学是在蛋白质水平发现分子标识的重要途径之一。定量蛋白质组学技术--相对和绝对定量的等量异位标签(isobaric tags for relative and absolute quantitation, iTRAQ)技术结合Nano-LC-MS/MS,对临床分离的结核杆菌链霉素(SM)耐药株01108、SM敏感株01105和H37Rv的全菌体蛋白进行定量蛋白质组学研究,通过相对定量分析SM耐药株与敏感株间的差异蛋白质,基于巴斯德研究所功能分类树,对两组差异蛋白进行相对分子量、等电点、酶分类以及功能分类分析,并根据差异蛋白理论分子量和等电点绘制了虚拟2D凝胶。同时,WEGO在线对差异蛋白进行功能注释聚类分析,并运用KEGG对蛋白参与的信号通路进行分析。SM耐药株01108与SM敏感株01105和H37Rv表达差异蛋白分别为194种和146种；SM耐药株01108与SM敏感株01105和H37Rv两者均有差异的蛋白有121种,其中7种差异蛋白在耐药株01108中表达上调大于1.20倍或下调小于0.55,分别是巯基过氧化物酶(Rv1932)、酰基载体蛋白脱氢酶(Rv0824c)、30S核糖体蛋白S15(Rv2785c)、丙酮酸脱氢酶E2部分(Rv2215)、双组份转录调控蛋白(Rv3133c)以及假定未知蛋白Rv2466c和Rv2626c。差异蛋白质相对分子量和等电点分布广泛,相对分子量和等电点范围为7.63kDa(Rv1498A)-326.22kDa(Rv2524c),等电点范围为3.74(Rv2244)～12.48(Rv2986c),超过50%的差异蛋白为蛋白酶。无差异蛋白质属于稳定RNA(4)、插入序列和噬菌体(5)、PE/PPE(6)和未知蛋白质(8),其他功能分类蛋白均被鉴定到,其中,参与中间代谢和呼吸作用(7)的差异蛋白分别占到两组差异蛋白的36.1%和32.4%；功能分类的差异蛋白有13种为核糖体相关蛋白。对SM耐药株01108与SM敏感株01105差异蛋白和SM耐药株01108与H37Rv差异蛋白进行分子功能注释分析,两组差异蛋白均以催化活性功能和结合功能为主。生物进程注释分析,SM耐药株01108与SM敏感株01105差异蛋白参与新陈代谢、细胞进程、应激反应和生物调节等14种生物进程；其中,参与新陈代谢过程和细胞进程的差异蛋白比例分别占到36.04%和26.9%；SM耐药株01108与H37Rv差异蛋白参与13种生物进程,以参与新陈代谢过程和细胞进程为主,分别占到34.02%和26.9%。KEGG分析发现鉴定到的蛋白共参与到72条信号通路。其中,有9条信号通路具有显著性(p＜0.05),包括柠檬酸循环途径、不饱和脂肪酸合成途径和RNA降解途径等。结核杆菌SM耐药株、SM敏感株和H37Rv定量蛋白质组学的研究,筛选出7种潜在的可能与结核杆菌毒力和耐药性相关的蛋白,为进一步研究7种蛋白在结核杆菌致病性、耐药性方面的作用提供依据。