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本试验采用RT-PCR技术成功克隆出了影响苹果梨果皮着红色的关键酶基因CHI和F3H并做了相关生物信息学分析,之后采用实时荧光定量PCR对其在解袋前后的表达规律进行了检测。结果如下：1.通过CHI、F3H基因保守区分别设计一对引物对苹果梨果皮cDNA进行扩增,得到了苹果梨CHI和F3H基因全长,大小分别为702bp和1095bp,推断其分别编码234个和364个氨基酸。2.比对结果显示苹果梨CHI、F3H与大多数已登录Genbank的蔷薇科植物碱基相似性在90%左右,部分物种高达98%以上。其中苹果梨CHI与西洋梨CHI基因相似度为98%,与沙梨CHI基因相似度为96%；F3H基因与西洋梨F3H基因相似度为99%,与苹果F3H基因相似度为98%。系统发育分析表明,苹果梨CHI基因与西洋梨CHI基因亲缘关系最近,沙梨次之；F3H基因与西洋梨F3H基因亲缘关系最近,草莓次之,与同为梨属的沙梨亲缘关系也较近。3.荧光定量PCR结果表明,套袋会抑制苹果梨果皮CHI基因的表达,解袋后CHI基因的表达量会先在短时间内达到一个较高水平,然后下降,之后伴随着果实成熟和花青苷积累CHI基因表达量又逐渐升高,说明CHI基因是受光诱导表达的酶基因,与苹果梨果皮花青苷的合成密切相关；套袋对苹果梨果皮F3H基因的表达起明显的抑制作用,解袋后F3H基因表达量会迅速达到峰值并一直保持在峰值左右,说明F3H基因也属于光诱导表达的酶基因,但与苹果梨果皮花青苷的合成关系并不密切,推测其可能与其他与花青苷合成有关的基因协调起作用。